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用户讨论:靖天子/存档9

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Merry Christmas!!!

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冠状病毒模板与RaTG13

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I have just finished translating template {{Coronavirus}} from Chinese to English.

I like this template, compared with "Human coronaviruses", which I just REDIRECT to "Coronaviridae", Its a DeAnthropocentrism template.--Htmlzycq（留言） 2020年12月24日 (四) 16:28 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：感谢阁下翻译这个模板，当初创建这个模板正是感到人们对感染人类以外动物的冠状病毒（或者更广泛来说，流行病学、疫情以外关于冠状病毒的病毒学知识）关注太少了。刚刚无意间发现英文版也有人写了RaTG13，便详细扩充了RaTG13病毒。英文版竟连冠状病毒的5' UTR、3' UTR、甚至3'UTR上的一个结构都自成一条目，真是绝了，希望今年有空时能在中文版将这些条目全部写完，并重写母条目冠状病毒，不过与Covid-19直接相关的条目因为容易被政治污染，我就不碰了。--Wikimycota~🍄 2021年1月4日 (一) 09:29 (UTC)[回复]

是在下先把阁下的中文版RaTG13翻译为英文的，后来他们几乎重写了条目，毕竟英语不是母语，有很多语法问题 囧rz……--Htmlzycq（留言） 2021年1月4日 (一) 09:33 (UTC)[回复]


I have created template {{Coronavirus genomes}} in enwiki. Do you have any suggestions for improvement?--Htmlzycq（留言） 2021年1月5日 (二) 02:48 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：感谢阁下贡献（不愧是“模板控”）。粗看一下，membrane protein连到一般的膜蛋白去了，这个连结还是去掉的好（应该没有办法为冠状病毒的M蛋白单独写一篇条目），outer membrane protein连到细菌的外膜蛋白去了（同上，这个也去掉比较好），非结构蛋白不同冠状病毒歧异性很大，命名方式也都不同，难以概括，目前唯一有条目的NS3是连到HCV的，不是冠状病毒的，关于冠状病毒的NS，我想应该有蛮多是有建立成条目的价值（例如SARS1/2的ORF8，这个可以大书特书），但目前都没有条目，可以等到有条目建立再放上去。
希望今年能在中文版将这些病毒学条目一一建立。题外话：中文版被埃及阿拉伯语赶超了？--Wikimycota~🍄 2021年1月5日 (二) 07:23 (UTC)[回复]

在下建立这个模板只是先试一下，想改的还有很多，比如在这次大流行中这么重要的spike protein英文至今都是重定向到Peplomer没有独立条目，这不应该啊，还有S蛋白的RBD，在下认为也有独立条目的必要。

题外话：是的，埃及阿拉伯语20年初就开始疯涨，2万起步一年内突破100万，11月初赶超了中文版，另外，9月乌克兰语版超过了葡萄牙语版，与中文的差距也从2016年的24万缩小到10万，更多见Wikipedia:统计/与邻近条目数量的语言版本比较存档--Htmlzycq（留言） 2021年1月5日 (二) 09:09 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：确实RBD有独立条目的价值，另外许多特定冠状病毒的辅助蛋白（有研究阐明功能的几个ORF）应该也能独立成跳目，例如ORF8 in SARS, ORF3 in SARS等，另外还可以写一篇冠状病毒的辅助蛋白统整介绍不同冠状病毒的辅助蛋白。阁下还有这方面的写作计画吗？
一年增加100万....跟瑞典语一样是刷物种吗？去年增加的条目大都是机器人刷出来的？--Wikimycota~🍄 2021年1月6日 (三) 09:07 (UTC)[回复]

没有，感觉在下没有这个能力，在下在英文建立的条目基本上都是stub。

题外话：好像刷了很多人物，和阿拉伯语一样，估计是同一批人干的--Htmlzycq（留言） 2021年1月6日 (三) 13:26 (UTC)[回复]

问一下刺猬冠状病毒和东北刺猬冠状病毒HKU31在Merbecovirus（支系C）中的亲缘关系是最近的吗？如果是，那该条目似乎应该和英文条目一样，移动到“刺猬冠状病毒1”，而原条目可像鼠冠状病毒（MCoV）一样作为这一类的总称当然，要有文献支持这样命名--Htmlzycq（留言） 2021年1月6日 (三) 15:39 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：是，这两个应该是最近的，刺猬冠状病毒1是前者，东北刺猬冠状病毒HKU31没有别名（好像也无人跟进研究），这两个相似度只有79.6%，以冠状病毒的惯例90%以上才被视为同种。刚发现英文版跟德文版都把Rat Coronavirus独立成条了，这个应该跟小鼠的是同种。还有Letovirinae，这个亚科是单型的，不知为何英文版条目是以亚科为标题，而非病毒（虽然后来我引用了去年介绍的太平洋鲑鱼病毒，但那篇仅是提到发现了与MLeV类似的病毒，没有提及是否视为同种，或发表为新种，而且在您补充前英文版也没有人注意到这个鲑鱼病毒的存在）当初我就很想在英文版把它移动到MLeV，因为单型的单元应该用最下级的阶层命名，也想过在Wikidata请求合并，但考量到在Wikispecies两者还是不同的entry，不知道怎么做。--Wikimycota~🍄 2021年1月7日 (四) 05:06 (UTC)[回复]

诚如阁下用户页所说，英文维基上也充斥着不少过时的内容，之前的Letovirinae就是一例，相信随着更多的对海洋生物病毒的探索，会有更多的勒托病毒被发现。MCoV这边，感觉 Mouse hepatitis virus 和 Rat Coronavirus 都应该算作 Murine coronavirus 下的“subspecies”，而 Sialodacryoadenitis virus 和 Parker's rat coronavirus 应该算作“Strain”，龙泉罗赛鼠冠状病毒的信息应该也可以加入Rat Coronavirus条目了。另外，Wikidata里很难合并的，即使物种名和异名都会有两个entry--Htmlzycq（留言） 2021年1月7日 (四) 06:43 (UTC)[回复]

英文版{{Coronavirus}}又给改成属-亚属的格式了，而且还是以字母顺序排序，看来Ypna他们只接受ICTV的命名，但在下觉得这样与Coronaviridae这个页面的点列式列表无异，相比之下阁下的模板更方便看出各个支系之间的关系。--Htmlzycq（留言） 2021年1月8日 (五) 12:27 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：真不知为何这么搞，ICTV收录新种病毒的速度是很慢的，而且经常有漏，像Pacific salmon nidovirus这种只是论文中稍微提及的删掉就算了，至少经论文在无争议的期刊上正式发表、命名的病毒应该都充分符合关注度才是。重写模板的人编辑摘要给出"rewrote entire template for taxonomic consistency and proper formatting"，不晓得是不是没有看懂原本的模板是反映支序分类关系，而认为仅是未经整理的inappropriate formatting......--Wikimycota~🍄 2021年1月8日 (五) 20:43 (UTC)[回复]

在下觉得像229E-like、NL63-like 这样的分类名明显好于 Duvinacovirus、Setracovirus 这样不知所云的ICTV亚属名，而且结构化的排布也很好反映了两者相近的亲缘关系，但他们要是以ICTV为权威，看来也只能这样了--Htmlzycq（留言） 2021年1月9日 (六) 02:52 (UTC)[回复]

RmYN02等

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另外，英文维基上有人觉得RmYN02符合关注度可以创建，见en:User_talk:ScrupulousScribe#about_RmYN02--Htmlzycq（留言） 2021年1月16日 (六) 11:14 (UTC)[回复]

这位用户他建立条目了，见en:RmYN02。另外有个问题，en:Bat SARS-like coronavirus WIV1和en:SHC014-CoV哪个离SARS-COV-1更接近？--Htmlzycq（留言） 2021年1月16日 (六) 17:27 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：WIV1可能近一些，用RBD做出的演化树WIV1比SHC014更接近SARS[1][2]（WIV1非常接近Rs3367），但没有找到全基因组下去比的，加上可能还有基因重组，我觉得真实关系难说，只能说都很接近。正好我有打算在中文版写RmYN02、SHC014跟ZC45的条目，这几个病毒株都有一定关注度，RmYN02是去年刚发现、跟covid相似度仅次于RaTG13且做出演化树甚至可能比它更接近covid，SHC014是石正丽曾经拿来做可以感染人类细胞的重组病毒引起一阵风波，ZC45是闫丽梦声称covid人工制造的来源株。--Wikimycota~🍄 2021年1月16日 (六) 21:57 (UTC)[回复]

谢谢阁下又写了Rc-o319病毒，另外，记得在下在一篇文章中看到SARSr-CoV这个“种”下发现的病毒，可以明显的分为三支，人SARS-COV-1和人SARS-COV-2分别位于其中两支，假设这个分支系统被新的发现继续巩固，这个“种”是否将来会分为此三个“亚种”？--Htmlzycq（留言） 2021年1月18日 (一) 16:44 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：冠状病毒好像不常使用亚种的概念，只会称是不同病毒株，种的概念则是以复制酶保守区相似度90%来界定。我看到的文章都是只有分成SARS-CoV-1与SARS-CoV-2两支，阁下记得另一支包含哪些病毒吗（还是能不能找到那篇论文）--Wikimycota~🍄 2021年1月18日 (一) 17:06 (UTC)[回复]
@Htmlzycq：找到了，是不是这篇，第三支是BtKY72与BM48-31两种蝙蝠病毒。--Wikimycota~🍄 2021年1月18日 (一) 17:38 (UTC)[回复]

嗯，那篇文章应该是时间上晚于这篇的一篇文章，那个时候刚刚被命名为SARS-COV-2。其中，第三支应该是包括BtKY72与BM48-31两种以及其它多种病毒的一支，分化点早于SARS-COV-1和SARS-COV-2的分化，但貌似复制酶保守区相似度仍在90%以上。不过可能由于没有产生可感染人类的病毒，所以很多文章的系统树并没有把这一支算进去吧。--Htmlzycq（留言） 2021年1月18日 (一) 18:29 (UTC)[回复]

  1. 是的，根据PMID:31296683这篇发现的文章，BtKY72可能是在非洲国家发现的第一种β-冠状病毒，应该有足够关注度。
  2. 根据PMID: 32699095，PMID：33219796这两篇文章，用基因组的不同片段建树，BtKY72与BM48-31所在的这一支，有时候在SARS-COV-1和SARS-COV-2的分化点之前分出来，有时候插在他两之间，但三者都很明显的单支，没有crosstalk。
  3. 临时先把拉尔夫·S·巴里克这个stub建立了，看了年初有人写的[3]，感觉他的故事可以多写一些。--Htmlzycq（留言） 2021年1月19日 (二) 12:04 (UTC)[回复]
@Htmlzycq：大概看了下PMID: 32699095是比较各病毒株S蛋白和各物种ACE的结合，好像没有提到支序分类？33219796这篇全基因组去做的树中BM48-31插在他俩中间（更接近SARS-1，但clade的分数只有64），相较之下我上面连结的那篇也是拿全基因组做树，BM48-31是在最基部（分化点早于SARS-1与2的分化点），结果不太一致（否则我会在条目中画支序图），可能是33219796分析的病毒株比较少造成，另外可惜它没有把RmYN02加进去比较。
另外刚才研究了一下这个“第三支”，有些新发现，从BM48-31的那篇发现了一支"Ghana-348"，是2009年这篇所发表（仅有RdRP保守区序列，未有全基因组序列），这支本身不被视为SARSr-CoV，而是SARSr-CoV的姊妹群，比HKU9更接近SARSr-CoV，这样它地位有可能接近蹄蝠乙型冠状病毒浙江2013，两者关系令人好奇。而2009年还有另一篇发表了许多肯亚的SARSr-CoV（也未有全基因组序列，仅有RdRP保守区），虽然演化树的解析度不高难以判读（甚至Betacoronavirus都不成单系群了），但粗看之下这些有可能也是SARSr-CoV中比较基部的演化支，可能地位也跟BtKY72类似。不过有完整基因组定序的应该只有BtKY72和BM48-31，两者我都会尽量写成条目（我自己对病毒关注度的门槛是具有完整序列，且论文中有特别段落介绍，所以一篇发表数十种病毒的论文，大概会有数种有写的价值）。前几天看2020.12.18石正丽在专栏中说"(Rc-o319) is the first full-length genome sequence of bat sarbecovirus reported in an Asian country other than China"，我还相当疑惑为何要强调"Asian"，追到这里才知道应该就是欧洲、非洲有BM48-31和BtKY72的缘故，可惜绝大多数文章都不提了，这些中国以外的病毒株对重构SARSr-CoV的演化史应该是非常有帮助的，不知道除了上述这些，阁下还有没有看过哪些中国以外的SARSr-CoV（穿山甲病毒应该也是，毕竟那穿山甲是从南洋走私到中国，不是原产在中国，几个月前Nature也有文章提及柬埔寨发现了接近SARS-2的RdRP序列，但尚未发表）--Wikimycota~🍄 2021年1月20日 (三) 02:11 (UTC)[回复]
@Htmlzycq：ZC45病毒与ZXC21病毒，这次是您们浙江的，这两个是疫情爆发时唯二已知与SARS-CoV-2在同一支的病毒，其他都是之后才发表的，所以去年爆红了....--Wikimycota~🍄 2021年1月20日 (三) 06:48 (UTC)[回复]

谢谢，其实舟山和台北到我家直线距离都是300公里，就是一个有跨海大桥一个没有，ZC45去年爆红了一下，但风头迅速被穿山甲病毒盖过去了 囧rz……

BtKY72与BM48-31两种所在的这一支（这里在下“原创研究”一下，暂时把它称为SARS-COV-3），现有的发现地基本上位于欧洲非洲，和SARS-COV-1、SARS-COV-2的主要发现地，华南及东南亚（在下认为算是一个地理区）有着“地理隔离”，因此应该是较早分离出来的基部的演化支，其独立演化过程中，应该没有与1、2发生重组。部分序列树显示的SARS-COV-3插在它两之间的可能是样本量少造成的偏误？ --Htmlzycq（留言） 2021年1月20日 (三) 10:05 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：对，可能是样本数较少所致（如我上则留言所说，PMID：33219796使用的样本较少）。最近越是研究，越发对SARSr-CoV的演化史感到好奇，并对为何SARSr-CoV是在东洋区（即华南与东南亚）、而非其他地方发生辐射演化感到百思不得其解，可惜没有查到任何类似的研究（估计关心的人太少，而且中国以外地区对SARSr-CoV的研究、调查相当不足），我想要回答这个问题，应该还得对蝙蝠的生物地理学有相当了解。这些资讯对于阻止下一次的疫情爆发应该相当重要（刚好阁下使用SARS-CoV-3，有些不吉，仿佛这“第三支”不让另外两支专美于前，在20X0年迸出了一个SARS-CoV-3又造成一番疫情）。
下一篇我便打算写穿山甲冠状病毒。待疫情结束，阁下应该来台湾一游。--Wikimycota~🍄 2021年1月20日 (三) 22:49 (UTC)[回复]

谢谢邀请，话说“不让另外两支专美于前”的可能性还真有 囧rz……，毕竟它分布范围这么广，看了保加利亚那篇论文，好像大多数蝙蝠在地中海南北都有分布，不知道在保加利亚和Kenya之间还有多少未知在等着人们去探索。关于对于阻止下一次的疫情爆发，在下记得石正丽20年的一次网络演讲中提到了她认为的有可能演化出感染人类的支系应该是重组变异最多的几个，另外在下想起了[4]一文中的Ralph S Baric，没有他在02年及更早先对冠状病毒的前瞻性研究，中国的科学家就不会这么快认识到“非典”是冠状病毒引起的，如果没有在03年爆发了非典，可能他会转行成为一个游泳教练，可以说是相互成就吧。不过石正丽和Ralph S Baric这二位现在变成了某些“阴谋论”的主角了 囧rz……

关于“穿山甲冠状病毒”，感觉和ZC45病毒与ZXC21病毒不一样，ZCZX两者关系非常近，目前没有发现舟山以外的病毒，但是广东截获的和广西截获的很明显关系不近，两者之间有其它的蝙蝠病毒在，说明东洋区的蝙蝠与穿山甲之间发生了多次相互传播的事件，估计以后会有很多“穿山甲冠状病毒”发现，建议条目在将来可以写成类似于蝙蝠携带的病毒的综述形式--Htmlzycq（留言） 2021年1月21日 (四) 03:53 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：作为从事基础科学研究的人，我对基础科学不受重视的情形深有体会（在维基百科好像也是如此），阁下有兴趣继续扩充Baric的条目吗？可参考这篇（有提到他非常擅长游泳，可惜没讲到他一度撑不下去要去当游泳教练...）。
穿山甲冠状病毒除了去年3月这篇发表的广西、广东型，至少还有[5][6][7]，其中PMID: 31652964是唯一一篇疫情前发表的，虽无完整序列，但可见穿山甲冠状病毒相当多样，甚至可能包含alphacoronavirus, deltacoronavirus的成员。而另外三篇都是疫情后发表的，这三篇的病毒应该很接近，都是RBD和SARS-CoV-2相似度极高（关键位点完全吻合），都是广东广西海关截获的穿山甲，但都没有把他篇的pangolin-cov拿来相互比较，看来条目不好处理，需要思考一下。
蝙蝠携带的病毒这个条目相当重要，百科性很强，在英文版是优良条目，等这些SARSr-CoV处理完，希望能将英文版完整翻译。--Wikimycota~🍄 2021年1月21日 (四) 06:23 (UTC)[回复]

聊聊其他的

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扩充Baric的条目还是留给其他维基人吧，在下最近想尽可能多的建立一些学者条目，哪怕是一个小条目，也可以帮助其他人。说道这个，怀念一下被错误封禁的User：镜海水手，当年我是这么问他为什么要写这么多科学家小条目的时候，他说图方便快速建立一些。

User_talk:靖天子/存档4#关于那个用户的禁封，User_talk:Jinghaishuishou#这到底是怎么回事！？

最近建立了好几个奖项等科学家有关列表如刘易斯·托马斯奖、美国科学促进会主席等，还能看到他当年所写的学者小条目--Htmlzycq（留言） 2021年1月21日 (四) 11:16 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：我简单扩充了Baric的条目，中文维基百科的科学家条目确实非常缺乏，记得我写过一些真菌条目，内文提到近十位科学家，清一色全部没有条目、一片绿色连结.....那位是武汉大学的朋友吧，转眼间竟已七年了，阁下当年说维基有点“万马齐喑”，然而现在中文维基的社群环境又不知比当年恶化几倍了，亏得阁下多年不辍写作大量生物与化学条目。也看到我早已无力更新的Portal:生物学/新进条目，很高兴这两年在阁下长期努力之下又持续运作。--Wikimycota~🍄 2021年1月21日 (四) 21:13 (UTC)[回复]

Baric已经提报DYK，另外Portal:生物学/新进条目现在在下也无力更新了，有几位不断更新动物物种的维基人在接力，虽然忽略了其它生物领域，但也算是一件幸事了--Htmlzycq（留言） 2021年1月21日 (四) 23:09 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：感谢提名，刚刚又多扩充了一些。一个小发现：刚疑惑为何2002那篇MHV cDNA的研究文中仅说 "In this study we report the first reverse genetic system for a group II coronavirus, MHV-A59"，后来查到在Baric成功组装MHV的cDNA前，已经有人组装了TGEV与IBV的cDNA（[8][9]），分别属group I与group III。
有注意到来了几位专门写恐龙、古生物的维基人，恐龙领域多年来出了几位专精的编者，算是中文维基百科的生物条目中难得比较多人关注的。--Wikimycota~🍄 2021年1月21日 (四) 23:42 (UTC)[回复]
是的，其实十年前的也是有几位专门写恐龙的维基人，许多Wikipedia:模仿专题/英语维基典范条目#非鸟恐龙里的优良条目是他们当年写的。--Htmlzycq（留言） 2021年1月22日 (五) 05:07 (UTC)[回复]
@Htmlzycq：穿山甲冠状病毒。仔细阅读[10]的全部数据后我对演化树中有Pangolin-CoV属于Deltacoronavirus与Alphacoronavirus的演化支感到相当怀疑，认为这应该是样本数过少造成，这篇文章自己附上的blast结果也认为那些病毒是与SARSr-CoV相似，且他们隔年的新文章[11]也只主张有一种SARSr-CoV。所以我认为已知的穿山甲冠状病毒应该通通属于SARS-CoV，条目中还是使用了分类框，当然它们彼此并不构成一个单系群，中间穿插有蝙蝠病毒，因此特别画出演化树让读者参考。穿山甲病毒被不同研究组多次发现，彼此间又缺乏比较（像是Pangolin-CoV-2020可能根本跟GD是相同的），资讯纷乱，实在是不太好写的一篇条目。
看了阁下的连结，感到古菌可能是在下有兴趣翻译的（但短期应该还是写冠状病毒为主），至于那一堆菇类的FA对读者的帮助感觉不大，我倒不是很有兴趣写--Wikimycota~🍄 2021年1月23日 (六) 02:44 (UTC)[回复]

谢谢阁下的贡献，由于维基不能原创研究，就算Pangolin-CoV-2020根本同GD相同也要等今年出一些综述性文章后，维基再来跟进引用。 另外，在下把Rc-o319病毒加上去了，毕竟是目前明确的SARS-COV-2里最远的一支。

古菌，相当重要的基础条目，在下13年的时候扩充过一点点，把“new domain”翻译为“新域的诞生”，近年来看到英文条目有了一些变化，比如分类树等，该跟新了。--Htmlzycq（留言） 2021年1月23日 (六) 04:11 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：WIV病毒。这大概是SARSr-CoV中最重要的，英文版整个写偏了，除了第一句话之外通通离题......阁下如有关于古菌条目的编写计画，我也可以帮忙。--Wikimycota~🍄 2021年1月23日 (六) 09:03 (UTC)[回复]

(？)疑问条目名不应该是WIV1病毒吗？

应该是阁下有什么计划，在下也可以帮忙才对

去年年中开始，在下基本上把哲人石丛书等翻译、创建的丛书条目作者写了个stub，见User talk:Ma3r#关于丛书类型条目的探讨，在下想继续下去，世纪人文系列丛书里的作者是一个很大的工程，--Htmlzycq（留言） 2021年1月23日 (六) 10:40 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：糗了，漏了个1，补上了。这么多作者看来是浩大工程。--Wikimycota~🍄 2021年1月24日 (日) 04:40 (UTC)[回复]
@Htmlzycq：YNLF 31C病毒与YNLF 34C病毒。我原以为这两个应该是ORF8跟SARS最接近的，相似度超过八成了，不料[12]竟发现潜藏在资料库中的两个中华菊头蝠病毒株ORF8和SARS的几乎相同，大出我意料之外，这其实几乎把原论文提出SARS-1是Rf, Rs两种蝙蝠中SARSr-CoV重组而来的假说给毁了，偏偏两篇没有互引，也没有其他文章引用比较，受限于原创研究而不能在条目中写太多。
查阅大量资料后感到SARSr-CoV的资料相当零散，没有完善的综述性文章概括所有重要内容，只好让在下斗胆在中文维基百科发挥此功能。另外关于阁下之前询问WIV1与SHC014和SARS-1的相似度，根据[13]这篇确实是WIV1略高0.2%，但这篇新发表的WIV16病毒跟SARS-1相似度96%，应是目前已知跟SARS-1最相似的（不计果子狸的话），这些在下都会尽快建立完善。--Wikimycota~🍄 2021年1月24日 (日) 10:05 (UTC)[回复]

条目数量

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嗯，之前在和Ma3r讨论的时候是把写书籍条目作为“三步走”的“第三步”的，但后来发现自己写作者条目stub越写越顺利（都形成固定的套路了）就想快点都建起来。另一个原因是这些作者中文译名都是有来源的，直接用译者给出的就行了，不会像写其他人需要“原创译名”，其实在下这段时间里写了《病毒星球》、《致命伴侣》这些书里给出的病毒学家、细菌学家等学者的stub也是因为译者给出了译名，不需要“原创”。

预测一下，2021年越南语、日本语的条目数量都应该会超过LSJbot当年搞大的瓦瑞瓦瑞语，中文版应该会在2022年初--Htmlzycq（留言） 2021年1月24日 (日) 10:10 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：（在下前一则留言凑巧与阁下编辑冲突了，好像没有ping到）至今仍对当年基金会放任、甚至公开鼓励这类用机器人刷条目的做法感到不解，那几个小语种维基也算是毁了。特别是物种条目，中文至今都未能清完当初错误、重复的条目。记得当年我们还在与越南语互相追赶，现在居然他们领先这么多去了--Wikimycota~🍄 2021年1月24日 (日) 10:39 (UTC)[回复]

原来基金会还公开鼓励过bot？真是大开眼界。

虽然没搞懂阿拉伯语和埃及阿拉伯语编者之间的关系，但在下这样推测：在那几位人肉机器人把阿拉伯语刷过百万条目后，被阿语版社群“赶走”了，之后他们转战埃及阿拉伯语刷了百万以上条目，直到数据库暂时性“枯竭”，不知道埃及阿语版接下来会有什么动作。

越南语也是14年刷过百万条目的，不过中文版也没什么好骄傲的，当年也是刷过条目，见{{Milestone}}--Htmlzycq（留言） 2021年1月24日 (日) 16:13 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：好像是某次年会上讲的，非但不考虑将那些小语种打回原型，还大加表扬了一番，不过我也是从别人处听说。记得埃及阿拉伯语版当初连是否获准设立都吵了一阵子，现在居然都超过中文版了。话说回来，当年我们先后跟越南语、瑞典语和宿雾语大战，真是一段热血的时光，虽然我没有能力操纵机器人参与，但每天看到客栈里大家为了同一目标讨论分工的氛围，包括好几位彼此不合的维基人都携手合作，让我更加体会到维基百科合作的精神，不过现在社群分裂至此，大概没机会再看到类似的场景了....
关于{{SARSr-CoV}}，有关注度的条目快写完了（HKU3病毒这种很久以前发表的病毒实在非常难写），其他关注度不足以成条的病毒株应该有上百个，思考了一下后我打算在SARSr-CoV条目中以列表的形式介绍，包括长度、发表时间地点、宿主与特征简述，如能顺利写完应该会是一篇篇幅庞大的特色列表。--Wikimycota~🍄 2021年1月25日 (一) 00:20 (UTC)[回复]

谢谢阁下贡献，之前阁下把HKU1写到了三十几，唯独少了3，在下还以为没有这个编号的病毒呢

列表的形式记录关注度不足的病毒株这个想法很好，希望能成为特色列表。--Htmlzycq（留言） 2021年1月25日 (一) 04:19 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：不好找，HKU3应该是第一个被发现的蝙蝠SARSr-CoV，发表时都还没有命名，全文找不到HKU3这个名称，只叫做bat-SL-CoV。这个列表我目前构想，是先以几个段落的文字介绍2003年以来至今SARSr-CoV的研究史，包括重要的几篇研究，和几个特别重要的病毒株，列表的部分栏位应该包括名称、宿主、样本采集时间、采集地点、发表时间、序列长度、有完整序列与否、成功分离与否、序列与SARS-CoV（或SARS-CoV-2）的相似度以及注脚。--Wikimycota~🍄 2021年1月25日 (一) 06:34 (UTC)[回复]

路过

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顾名思义，路过。这就是神仙打架嘛 Orz —— Eric Liu 创造は生命（留言．留名．学生会） 2021年1月26日 (二) 03:09 (UTC)[回复]

@Ericliu1912：没看懂，哪里打架啦？--Htmlzycq（留言） 2021年1月26日 (二) 10:39 (UTC)[回复]
我也知道这个词用的不好，要说的话应该是“神仙讨论”，但显然原创用词不会有人看得懂（ —— Eric Liu 创造は生命（留言．留名．学生会） 2021年1月26日 (二) 14:08 (UTC)[回复]
@Ericliu1912：没事。刚发现，原来英文版的菊头蝠科最近成为了特色条目了，有一段整理了其SARSr-COV的数量，见en:Horseshoe bat#Coronaviruses --Htmlzycq（留言） 2021年1月26日 (二) 14:11 (UTC)[回复]
英文维基百科的优质内容产制速度血洗本地啊，生物学方面算是本地相对落后的一个领域。多亏有靖天子阁下等人奋力撑著门面。—— Eric Liu 创造は生命（留言．留名．学生会） 2021年1月26日 (二) 14:14 (UTC)[回复]
  • @Ericliu1912、Htmlzycq：感谢，第一次听到这个词。不过“撑著门面”还不敢当，门面应该是生物学中比较重要、点阅率高的基础条目，中学课本就会介绍的概念，这些“门面”不幸在中文维基百科中大多质量很低，过去虽曾有许多获选优特条目（例如个人印象很深刻的光呼吸），但2012左右通通被撤销了，那些条目的主编也早已离开维基百科。我个人写“门面”的优特条目大概只有5条左右（真菌、白色念珠菌、管胞、糊粉层、巴尔小体），还有很多我希望能写成优特的，包括古菌、转录、转译、核糖体、tRNA、mRNA、rRNA、miRNA、RNA、RNA世界.....只是这些大都需要原创编写，而需要长期规划整理。
  • 计算病毒株数目我觉得不一定能反映多样性，毕竟有的毒株彼此高达99%相似也被视为不同的，可能某篇研究多采了几只蝙蝠就多几个病毒株了。说到蝙蝠，这么多年来我好像没看过任何一位维基人写蝙蝠的条目，也没印象有在DYK见过，打开翼手目分类表，大部分是红字，蓝字也全部都是小作品，大概放几年都不会有人写，可能等得哪天有对蝙蝠有兴趣的“神仙”加入才能改善。--Wiki SL-CoV🦠 2021年1月26日 (二) 20:25 (UTC)[回复]

en:Template talk:Coronaviridae，Ypna 建议我们中文也该改成他那样的，该怎么和他解释好呢？--Htmlzycq（留言） 2021年1月27日 (三) 16:09 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：我上去留言向他解释了。另外英文版把gamma跟delta完全搞反了，不但模板里写反，很多条目里也写反，这错误实在是......看了编辑纪录，不知道是不是ICTV网站上写反了（我打不开ICTV网站上的分类表）。
倒是有一点收获，就是发现了几个漏写的鸟类病毒（有些是去年刚发表），例如鸭冠状病毒2714、鹅冠状病毒CB17，哎真是永远没有写完的一天。--Wiki SL-CoV🦠 2021年1月27日 (三) 21:22 (UTC)[回复]

看了一下ICTV没搞错，Ypna搞错了。另外，他用的NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b、Myodes coronavirus 2JL14也全都是ICTV里的物种名--Htmlzycq（留言） 2021年1月28日 (四) 02:09 (UTC)[回复]

ICTV等

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  • @Htmlzycq：打扰了，能不能帮我看下ICTV网站（不知为何我用任何浏览器都显示错误页面），gammacoronavirus现在是不是分成五个物种（Avian coronavirus, Avian coronavirus 9203, Duck coronavirus 2714, Beluga whale coronavirus SW1与Goose coronavirus CB17）？网站上有提供支序图或其他分类资讯吗？谢谢。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月3日 (三) 01:28 (UTC)[回复]

是的，ICTV的分类系统里，gamma分为三个亚属，五个种，和当前英文版一致，其中 Avian coronavirus 是 Igacovirus 的“模式种”--Htmlzycq（留言） 2021年2月3日 (三) 01:40 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：感谢，我将扩充鸟类冠状病毒条目至优良条目。火鸡的看来也被归入9203了。最基群是鲸豚那只吗？看到有文章说CB17是Igacovirus（三个鸟类病毒物种）的姊妹群。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月3日 (三) 01:58 (UTC)[回复]

ICTV的分类里，都是三个三个并列，看不出来谁是基群--Htmlzycq（留言） 2021年2月3日 (三) 02:10 (UTC)[回复]

在下有这种感觉：和最新文献中给出的分类系统相比，英文维基更倾向于使用已有的网络数据库给出的分类系统，哪怕数据库本身已经有点过时，比如在下之前在和Boghog讨论的{{转录因子与细胞内受体}}中的Paired box (3.2)等分类编号来自于TRANSFAC数据库，见en:User_talk:Boghog中的About_{{Transcription_factors_and_intracellular_receptors}}

PS:96%是个挺神奇的病毒全基因组相似度，SARS-COV-1和WIV16病毒，SARS-COV-2和RaTG13病毒，OC43和牛冠状病毒--Htmlzycq（留言） 2021年2月3日 (三) 03:21 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：恐怖唷，不知道这3-4%是不是某个很难变异出来、感染人类所需的关键元件（ORF8?），一旦越过这最后一道关卡人类就沦陷了（好像在讲Great Filter（英语：Great Filter））
用资料库的好处是简明、编辑门槛低、好维护，但如果有人对这个领域很熟悉（Ypna应该也是病毒学的专家）人为去抓文献可以得到比较丰富的结果。
另外感谢阁下创了MALAT1，还有兴趣写其他基因吗？我特别喜欢lnRNA，有机会可以扩充。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月3日 (三) 06:14 (UTC)[回复]

在下觉得应该不是Great Filter（英语：Great Filter），而只是采样密度的问题，随着田野调查的深入，应该会发现相似度更高的不能感染人的病毒，除非MERS等一系列别的也卡在96%

PCGEM1、His-1、MALAT1、H19这几个，是在陈润生院士的公开课第三集中看到的，见[14] --Htmlzycq（留言） 2021年2月3日 (三) 06:46 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：是的我是开玩笑的 囧rz……，应该是取样误差所致，跟MERS最接近的是祖鲁棕蝠冠状病毒，没有做全基因组定序，但看RdRP的差异，两者应该还是差蛮远的。期待哪天能发现跟SARS-CoV-2相似度99%的病毒。
阁下工作之馀还看公开课，并将所学写成条目，要是有更多生物学者这么做就好了。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月3日 (三) 18:50 (UTC)[回复]

鼠冠状病毒已帮阁下提名DYK，另外，大鼠冠状病毒是单系群吗，还是和穿山甲冠状病毒一样的复系群？能做一个M-CoV内部的系统树吗？--Htmlzycq（留言） 2021年2月5日 (五) 01:21 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：感谢阁下提名，冠状病毒写到一半发现这条还有许多内容能写。小鼠跟大鼠的应该都是单系群，但大鼠中SDAV跟帕克有可能不是（有人认为帕克只是SDAV的一型），不过没有看到有人做鼠冠状病毒之下各株的演化树。浙江那两支鼠病毒的位置也很不清楚（不同区段做出的结果不同），Puffinosis是污染的机率很高（真是感染鸟类就有趣了）。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月5日 (五) 06:18 (UTC)[回复]
  1. 明白了阁下对DYK 应该只上一次的想法，不过在下觉得wiki上关于科学的内容应该多多宣传才是。
  2. 在下感觉Puffinosis应该是污染吧，毕竟1982年的实验，如果放在今天，应该会先来一次组织RNA测序，看看有没有冠状病毒RNA。
  3. 突然发现HKU24也是在大鼠中发现的病毒，那大鼠冠状病毒这个条目未来应该改为对“所有能感染大鼠的冠状病毒”的综述性质条目。
  4. 结合A支系大部分都在啮齿动物（鼠类、兔类），估计有好多次传播到大鼠的事件，待以后看看怎么写吧。
  5. “可能是起源于鼠类，而非蝙蝠” 这样表达感觉不妥，毕竟整个α、β冠状病毒都是起源于蝙蝠，这样表达会让读者以为此病毒的演化路径无关蝙蝠，“早先就传播到啮齿动物”、“在啮齿动物中长期独立演化”（还是阁下来组织语言吧）

--Htmlzycq（留言） 2021年2月5日 (五) 07:30 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：
    1. 确实，科学条目少得可怜，不成比例，DYK跟优特条目经常半条科学条目都没有，过去一直想推广专业人士进来写，多年来的感想还是我自己动手写最快。不过说到这我倒是突然想到，阁下是不是之前有召集身边的人合写生物条目过？
    2. 是的，后续也无人研究了，但是个挺吸引人的假说（原论文声称只有患病鸟类组织感染的小鼠中可以分出病毒，其他小鼠中没有），毕竟gamma跟delta都有外溢到哺乳类，alpha跟beta外溢到鸟类也是可以想像的。
    3. 是的，感染大鼠中的冠状病毒有三：1.MCoV下的所有大鼠冠状病毒、2.HKU24、3.alpha的鹿城褐家鼠冠状病毒，小鼠的则有二：1.MCoV下的MHV、2.乙型冠状病毒1型的龙泉黑线姬鼠冠状病毒（LAMV）。但后面几种几乎无人讨论，文献中提到"Rat Coronavirus"、"Mouse Coronavirus"还是都只在讨论MCoV底下的。如果之后有更多种病毒发现，可以将大鼠冠状病毒独立写成综述条目。兔也有类似状况，除了HKU14外至少有两株很早就发现但无人研究的冠状病毒。
    4. 确实可能有此误解，还是您想得周到，我稍微调了一下，您看能不能再调。可惜这个假说提出时就只是一笔带过，写太多怕有原创研究的感觉--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月5日 (五) 09:29 (UTC)[回复]

鼠类的冠状病毒

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在下还有个问题，在A支系中，ICTV给出的是五个物种，en:Myodes coronavirus 2JL14应该在系统树的哪里？--Htmlzycq（留言） 2021年2月5日 (五) 15:04 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：阁下不提的话我还不知道有这病毒，一查发现很有意思，是来自这篇文章[15]，这篇是大规模鼠类病毒的survey，没有深入探讨冠状病毒，但发现了支序A大量的鼠类病毒（Fig.5)，感染包括不同属的许多物种（不只大鼠与小鼠），2JL14在beta-CoV-1的那一支，不考虑基部那个HJL2015的话树型还是MCoV, HKU1 以及 beta-CoV-1两大支，比起HKU24那篇只发现一种就宣称支序A共祖是鼠病毒，这篇的结果才真正说明了这点。
另还有两点让我惊喜的：1.AlphaCoV那边有许多跟鹿城鼠病毒相关的，表示这不是孤例，AlphaCoV那里真的有一大支跳到了啮齿类；2.Alpha基群是一个在西藏鼩鼱发现的病毒，马上让我想起之前写过的文成鼩鼱病毒，在演化树上也是AlphaCoV的基群，看来这也不是孤例。可惜这篇作者并未引用文成病毒那篇。
ICTV独列2JL14是我不太能理解的，2JL14的位置并不特别特殊。这些病毒株本身根本没有任何介绍，应该是不符合关注度的，写了2JL14，就没理由不写另外20几个病毒株的条目，真的要写的话写成“鼠类的冠状病毒”（Coronavirus in rodents）比较合理。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月6日 (六) 10:16 (UTC)[回复]

谢谢阁下指出了这篇文章，这篇文章中冠状病毒的内容是Figure 5a 与 Figure S6，分别以RdRp和S蛋白建立的系统树只不过鹿城褐家鼠冠状病毒没有在S蛋白树中列出，HKU24在RdRp树中也标红了让人难找，写作的时间应该晚于User_talk:靖天子/存档8#有关冠状病毒里提到的HKU24和鹿城褐家鼠冠状病毒发表的时间，但早于文成鼩鼱病毒（WESV）的发表时间[16]MCOV中的LRLV和β1CoV中的LAMV在这篇文章中分别标为“longquan-708”和“longquan-343”？

貌似无论RdRp还是S建树，与OC43关系最近者都不是牛冠状病毒，牛冠状病毒只是全基因组与OC43最近吗？还是β1CoV中有其它更近的？

文成鼩鼱病毒（WESV）与这篇文章提出来的Shrew-CoV/Tibet2014的关系不知道后来有没有人做过？

这篇文章里和鹿城褐家鼠冠状病毒最近的是福建省发现的RtRl-CoV/FJ2015，这么近的距离，估计真的是 in situ evolution --Htmlzycq（留言） 2021年2月6日 (六) 15:51 (UTC)[回复]

再看了一遍，doi:10.1016/j.virol.2014.10.017文章的RdRp树中，明明龙泉罗赛鼠冠状病毒（LRLV）和HKU1是最接近的，为什么又说LRLV belong to the established species murine coronavirus，而ICTV里HKU1是单独一个species的？

阁下的“鼠类的冠状病毒”（Coronavirus in rodents）的想法在下觉得确实有意义，在下试着先在沙盒里写了一点点，不过感觉很快就会碰到“原创研究”。

最后，ICTV把2JL14独列的原因估计是它是完成全基因组的12个之一，而且RdRp相似度刚好小于90%一点点。--Htmlzycq（留言） 2021年2月6日 (六) 16:54 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：没有人做文成鼩鼱与西藏2014的关系，文成那篇发表于2017年8月，大规模鼠病毒研究是2018年10月，且后者内文还特别强调了西藏鼩鼱的特殊演化地位，可惜没有引用前者一起讨论，看起来西藏跟浙江中间应该还有大量鼩鼱病毒才是（刚发现鼩鼱原来跟啮齿目关系是很远的）。
LRLV的地位用不同区段建树结果不同，有时更接近MCoV，有时更接近HKU1（RdRP是跟HKU1分成一群），其中龙泉708可能是两支鼠病毒重组产生，所以我在鼠冠状病毒中使用比较有弹性的描述，形容它跟MCoV、HKU1都很接近，但是作者选择将其归入MCoV，估计是当时不知HKU1有鼠病毒，根据大规模鼠病毒研究结果，LRLV（龙泉708）应该是在HKU1这一支（因为地位模糊我就没有画在演化树上了），LAMV（龙泉343，龙泉黑线姬鼠冠状病毒）确实在betaCoV1那一边，但跟HKU24和其他鼠病毒成一支，跟其他betaCoV1没那么近，看起来不应该算betaCoV1的一株，否则兔HKU14跟HKU24也都能归入betaCoV1了我一开始真的因为红字漏看了HKU24跟LAMV。现在冠状病毒这么火红，期待能再有几篇这样的大规模调查研究（特别是中国以外的）出来。
OC43跟马、牛关系估计都很接近，也是不同区域做的结果不同，不知道是不是也有重组发生（但目前看到文章都咬定OC43是直接从牛分家）
“鼠类的冠状病毒”，可以alpha、beta分段，alpha讲鹿城那一支，beta至少有MCoV、HKU1-like、HKU24/LAMV-like三支，然后再一节讲演化（确实有点原创总结的感觉）。同理还有“蝙蝠的冠状病毒”、“鸟类的冠状病毒”。
顺带一提，鼠冠状病毒经过这几天扩充，感觉足够典范条目了，打算在优良条目之后提出，阁下认为这个条目还有没有哪些内容可以写的？--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月6日 (六) 22:03 (UTC)[回复]

有没有这种可能，LRLV（龙泉189、370、708）、LAMV（龙泉343）发表时，HKU1、14都已经发表了，但是ICTV并未更新，其A支系中，给出的只有两个物种：β1-COV 和 M-COV，所以那篇文章就暂时放入了这两个？--Htmlzycq（留言） 2021年2月7日 (日) 01:10 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：我觉得挺有可能的，毕竟ICTV比较常用“物种”的概念，文中说established species确有可能是指ICTV认定的。不过HKU1早在2005年就发表，这也拖太久了。另外今天偶然发现了一个阁下应该会有兴趣的列表：en:Royal Society of London Michael Faraday Prize，感觉阁下会有兴趣撰写此条目以及上面的科学家。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月7日 (日) 07:54 (UTC)[回复]

鸟类的冠状病毒

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  • @Htmlzycq：谢谢阁下建立了伦敦皇家学会迈克尔·法拉第奖，写完后应可评选特色列表，其中有位获奖者Nick Lane是我相当崇拜的演化学家，他的书可说是我生物学的启蒙之一。我打算开始写鸟类冠状病毒，这个条目阁下建议该如何处理，应该只收录现ICTV定义的Avian Coronavirus（包括一些IBV病毒株、一些鸭病毒株[17]），将Avian coronavirus 9203（包含Turkey Coronavirus跟一些IBV的病毒株）跟Duck coronavirus 2714另立条目，还是将这些都写在同一条目中？这些病毒分类相当混乱，Duck coronavirus 2714那一支也包含许多名为Avian Coronavirus XXXX的病毒--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月7日 (日) 21:47 (UTC)[回复]

不敢当，不敢当，能像刘易斯·托马斯奖一样把坑填完就行了，话说这两个都是科普类的奖项，有好多人获奖者重复的

感觉“鸟类的冠状病毒”和Avian coronavirus、IBV的处理方式可能要像鼠这样处理：

综述性条目 ICTV定义的物种 模式株
鸟类 鸟类的冠状病毒 禽冠状病毒 禽传染性支气管炎病毒
英文 Coronavirus in birds Avian coronavirus, A-COV Avian infectious bronchitis virus, IBV
鼠类 鼠类的冠状病毒 鼠冠状病毒 鼠肝炎病毒
英文 Coronavirus in rodents Murine coronavirus, M-COV Mouse hepatitis virus, MHV
  1. “鸟类的冠状病毒”，可以gamma、delta分段，gamma里似乎除了Cegacovirus，都是鸟类的？
  2. “禽冠状病毒”里可以一笔带过以Avian coronavirus 9203为模式株的另一个ICTV定义的种，主要介绍该种下各个株
  3. IBV建议还是移动回原条目名，顺便吐槽一下英文维基对这里的处理："Avian coronavirus (IBV) is a coronavirus that infects birds, causing the associated disease avian infectious bronchitis (IB). "让人一头雾水

另外，阁下不先把冠状病毒提报DYK吗？还没上过，再不提报要过期了 --Htmlzycq（留言） 2021年2月8日 (一) 06:05 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：鼠肝炎病毒我没有另立条目，直接写在鼠冠状病毒里面，阁下的意思将禽冠状病毒（Avian Coronavirus、ICTV的那个种）与传染性支气管炎病毒（IBV）分成两个不同条目吗？这里比鼠类更难处理是因为MHV至少通通是从属于M-CoV之下的，但IBV不同的株系分散在Avian Coronavirus以及Avian Coronavirus 9203这两个物种中，另一点是Duck coronavirus 2714下的许多病毒株又叫做Avian Coronavirus XXXX（[18]此篇Fig.1有清楚的演化树）。如果分开的话，禽冠状病毒跟禽冠状病毒9203就只讲分类，传染性支气管炎病毒才介绍病毒机制与疾病？另一种处理方式是只写一个条目禽冠状病毒，将Avian Coronavirus, Avian Coronavirus 9203跟Duck coronavirus 2714的分类，下面各病毒（包括IBV、火鸡病毒、鸭病毒的分子机制流行病学研究历史）都包含在内。
是的，gamma只有Cegacovirus是哺乳类，有一点让我感到意外的是，原本以为鲸豚这支是从某个鸟类病毒外溢过去，应该散落在鸟类支系中，但Cegacovirus其实是整个gamma的基群，在演化史上是个有趣的课题。
DYK只有中间不要中断超过7天都行的，我这里还有许多内容可以迅速的“打将”（不知道阁下下不下棋，借用围棋术语）--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月8日 (一) 07:05 (UTC)[回复]

原来IBV和Avian Coronavirus的关系这么复杂，在下感觉IBV作为条目应该就写作为模式株的 NC 001451 的发现与研究，至于 KY 805845 、 MK 937829 这些分类在9203里的一笔带过吧

如同这篇文章指出的发现了多个鸟类冠状病毒物种，在下觉得根本问题是RdRp同一性大于90这个单一标准过于武断，导致2JL14、9203等奇怪的物种名

在下是赞成分开条目的，但是禽冠状病毒跟禽冠状病毒9203最好先缓一缓不写，估计2020年的这篇文章之后，ICTV会更新gamma和delta的种属分类，现在可以先把（包括IBV、火鸡病毒、鸭病毒的分子机制流行病学研究历史）都包含在 Igacovirus 或鸟类的冠状病毒条目内。

PS:[19]这篇文章里，2018b版的ICTV分类，gamma还只有两个亚属两个种。

PS2: 想到一个综述性条目避免“原创研究”的方法，[20]里 dual-published both in the journal and Wikipedia --Htmlzycq（留言） 2021年2月8日 (一) 11:42 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：在下认为ICTV短期内应该不会更新gamma的物种数了，虽然那篇文章提出应该多列鸽子与鹅的两病毒物种，但两者都缺乏完整序列，感谢这篇文章的作者详细介绍了整个鸟类冠状病毒复杂的分类状况，我感觉现在文献中人类之外冠状病毒的综述文章相当缺乏。

MHV的文献很多分别介绍不同病毒株（MHV-JHM、MHV-A59、MHV-3）的，不过IBV的文献好像都是将其视为一体介绍，很少有专门介绍NC001451、KY805845等专门株系的（不过我还也没开始细找），但IBV本身又是个复系群，加上鸭冠状病毒很长一段时间被视为A-CoV，在下感觉如您所说，建一个Igacovirus的条目把这三个物种全部包含在内是最适合的（IBV、火鸡病毒、鸭病毒、ACoV、ACoV9203都重定向到这条目），之后若有馀力再写鸟类的冠状病毒（综述文章，包含gamma与delta的），但以Igacovirus为这一大型条目名称又感觉有点别扭。
阁下提供“谈冠色变”的文章，里面有许多有意思的中文名，像“普氏蹄蝠冠状病毒Zhejiang2013”“黄鼠冠状病毒HKU24”，要不要把这些条目移动到相应名称？
Whoa! 感谢阁下提供PloS Wiki，看起来太有趣了，感觉比在中文维基写条目有趣多，我都快跳槽了，不过我挺惊讶为何多年来文章这么少，PloS Genetics与PloS Computational Biology各约十篇左右，PloS One则一篇都没有，这可是全世界的作者啊，不晓得是不是他们审稿很严，还是大多数科学研究者不会像我俩这样业馀去钻研一个主题....--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月8日 (一) 23:53 (UTC)[回复]

翻译与译名问题

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如果有发表文献支持，那还是移动吧，貌似“China Rattus”在中国大陆被称为“黄鼠”？同时感觉在下18年开的某菌菇译名的玩笑，最后导致阁下对社群某些事物心灰意冷，实在不好意思啦

跳槽应该算不上吧，毕竟可以草稿里中英文双向并进吗，吐槽一下自己在英文写的很多stub条目都没有翻译到中文，主要也是人名译名问题

PloS Wiki 上应该可以用类似 HKU1-related coronavirus 这样的符合惯例的“原创”分类名吧--Htmlzycq（留言） 2021年2月9日 (二) 04:02 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：刚刚移动了HKU24与浙江2013的标题，这篇中文文章还是有许多类似“鲁布巴特蜜环菌”的译名，果蝠属（Rousettus）给翻成了“卢塞图斯蝠”，伏翼属（Pipistrellus）给翻成“皮皮斯特勒斯蝙蝠”这样荒谬的名字，看到这些我不禁想起阁下当年开玩笑说如果有人想在中文维基建立“鲁布巴特蜜环菌”，他首先需要发表一篇中文论文使用此名，再到中文维基来移动名称.......不过我对中文维基的社群不再抱持希望，其实是社群长期沈沦退化使然，大概到我退选管理员才完全绝望，跟译名事件没有直接关系。看看现在的中文维基，社群沉痾、体制僵化，众人以方针指引为利剑刺向彼此，新手被非常粗暴地对待....说到“跳槽”的话题，不瞒您说，我确实有在考虑将重心移到英文版，例如把自己在中文写的优特翻译到英文版，或在英文版写出优特后再自己翻译过来。
还是别说这些不开心的了，说些有趣的。刚翻查HKU24时看到这篇[21]，delta居然都外溢到鼠类去了，看完让我更加觉得在PloS Wiki上写"Coronavirus in rodents"是个好点子，不知道PloS Genetics或PloS One会不会有兴趣收录这样的文章；还有这篇[22]（这篇的主题其实相当符合PloS Topic Article的内容形式），竟有在海豹中发现alpha与gamma CoV的纪录。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月9日 (二) 23:08 (UTC)[回复]

谢谢阁下分享文章，说说在下的几点发现

1. PLOS ONE并不是没有发表于enwiki的文章，不过只有一篇en:Dicke model在下完全看不懂在说什么 囧rz……

2. 感觉"Coronavirus in rodents"是个很重要的话题，虽然没有文献明说，但目前的数据很明显指出HKU1、HECV-4408和OC43都是传播到人的以鼠类为 reservoir 的冠状病毒，不过传播途径不同：

HKU1 HECV-4408 OC43
来源 某支接近LRLV的鼠冠状病毒 某支接近LAMV/HKU24的鼠冠状病毒 某支接近LAMV/HKU24的鼠冠状病毒
中间宿主 可能没有 β1冠状病毒中的牛冠状病毒 某支β1冠状病毒
影响 可能大范围传播过 个例 大范围传播
受体 9-O-Ac-Sias 9-O-Ac-Sias 9-O-Ac-Sias

3. frontier上的那篇mini review的篇幅相对PLOS Topic Pages短了一些。个人感觉，其实mini review的篇幅更适合维基百科，如果"Coronavirus in rodents"要写到PLOS Topic的篇幅，像上面传播到人的鼠类冠状病毒内容也要写进去了，还有地理分布等。

4. α1CoV的姊妹群被叫做α2CoV，这有足够的参考文献支持吗？如果这样命名形成惯例的话，那β1CoV的在鼠类的冠状病毒中的姊妹群也可以被叫做β2CoV了？

--Htmlzycq（留言） 2021年2月10日 (三) 04:11 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：PloS Topic Article这样的平台应该好好对科研人员推广才是，应该比WikiJournal的吸引力高多了。是的，鼠类在此扮演的角色很关键，且考虑到人类接触老鼠的机率远大于接触蝙蝠的机率，这样的传播事件应该发生了很多次，只是因不造成严重疾病而不为人知罢了。

α2CoV的命名来自[23]，不知道"Murine Coronavirus"的定义会不会扩大到包含整个Embevirus的鼠病毒。
在这里存放一些昨晚查到有关鼠病毒的文章或资料库中的序列[24][25][26][27]（unpublished）[28]（unpublished），如果有机会写"Coronavirus in rodents"所需的文献，我会继续收集，阁下如有发现遗漏的也欢迎贴在这里。目前看来鼠病毒的主要支序应该是清楚了，Alpha一支（鹿城等），Beta三支（M-CoV、HKU1-like、HKU24-like，但后者有可能再细分），没有明显地域性（有两篇是欧洲样本），但树形每一篇有些许差异，我有机会可以自己用软体将所有序列跑一遍试试（毕竟可以明目张胆的原创研究了）。另外兔HKU14那边也有许多接近的兔病毒，且alpha也有一支兔病毒（跟古老文献中发现的兔肠道病毒吻合）。此外鼩鼱病毒也是alpha的一支，应该位在比较基群（仍有分歧），虽然非啮齿类，许多文献把它跟鼠一起讨论。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月10日 (三) 22:03 (UTC)[回复]

[29]刚报道的一个SARS-COV-2相关的东南亚蝙蝠病毒。感觉可以在"Coronavirus in rodents"里顺带介绍兔病毒和鼩鼱病毒，一个宿主亲缘关系近，一个生活习性近（在我这外行人看来是这样）。另外，法国的那篇文章，里面列出的好多系列都没见过，看来在下之前看文章的地域性太重了--Htmlzycq（留言） 2021年2月11日 (四) 03:19 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：感谢阁下分享，竟又有SARS2相关的出现，想必今年还会再有，希望我都能如期写完。那篇法国的文章中使用的许多序列是仅有上传到NCBI，未有相应发表文章的，这些序列我正在NCBI收集，有些来自两三个最后没有发表鼠类研究，有些是其他啮齿动物中发现的孤例（飞鼠、豪猪、裸鼹鼠），不清楚是偶然的外溢还是确实在野外存在此病毒，这些零星序列可在Coronavirus in rodents中可列出一表格整理。兔与鼩鼱也可用一“相关病毒”之类的段落概括。感觉能写的内容相当充足，在下认为已经可以寄信给PloS Genetics或PloS One负责Topic Article的人询问他们是否对这样的文章有兴趣。
另外一点离题的：刚刚写了贺岁条目王氏水牛，换换口味，这篇文章不知道阁下能不能打开，记得知网以前可免费预览几页，现在好像不行了（如果要付费的话就不麻烦了）。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月11日 (四) 08:41 (UTC)[回复]

新春快乐！！！

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祝阁下新春快乐！！！

在家不能打开cnki，如果在学校应该可以，话说在下前几天在PloS Genetics的编辑里留言问了关于一个图片的改进问题en:User_talk:Evolution_and_evolvability#about_this_image--Htmlzycq（留言） 2021年2月11日 (四) 09:43 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：新春快乐！待阁下有空时看看（不急），如果内容没什么重要的，也没什么能写在条目中的新资讯就不用了，如果有少许资讯阁下认为能在条目补充就直接编辑条目吧，如果资讯量多复杂，看能不能发送至我的邮箱（我用于维基百科的专门邮箱：[email protected]），或用网路存储空间分享给我，看阁下方便哪种方式都可以，感谢啦！
这位editor竟是活跃数年的维基人，我写信问问他对Coronavirus in rodents的想法，待有回复再通知阁下。--Wiki SL-CoV🦠 2021年2月11日 (四) 19:28 (UTC)[回复]

关于RaTG13，一个好消息是，这一个月内被翻译成法语等多个语言；一个坏消息是，‎Alexbrn将‎Phylogenetics一节都删去了，原因似乎是“生物医学条目不能只有一手来源”？--Htmlzycq（留言） 2021年2月12日 (五) 16:29 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：这有点胡闹了啊....他移除的内容只是RaTG13跟SARS2的相似度、SARS跟SARS的相似度、RmYN02跟SARS的相似度，WP:非原创研究：已发表且可靠的第一手来源（如由大学出版社或主流报纸发表）可能可以使用于维基百科，但应小心谨慎，以避免滥用。对第一手来源的任何解释都需要可靠的第二手来源的相同解释加以支持。如果没有第二手来源，第一手来源只能用于描述性断言），以这种新发表的物种（病毒）而言，势必得主要使用第一手来源（发表物种的论文）撰写，单纯客观的事实（外观、各项数据、序列相似度）可以直接叙述，牵涉到提出理论解释的（根据实验结果提出的假说、作者认为的演化过程）则应小心使用，例如加上“作者认为”“有学者提出”“可能”等字眼，但相似度.....come on
退一万步说，发表RaTG13的原始论文已被多篇其他论文引用，有多篇论文提及RaTG13和SARS2的相似度为96.2%，引述那几篇论文至少（在佐证这句话上）可算是第二手来源，如果非要等到有综述性文章提到这个数字才能写入，太不现实了。
另外，惊觉英文版有人写了RacCS203，点进去看果然是阁下。中文版也有打算写吗？--Labyrinthulomycetes🦠 receptor 2021年2月13日 (六) 00:33 (UTC)[回复]

中文暂时没打算写，只是试一下英文维基对最新文章报道的病毒株系的反映，果然被加了个{{one source}} 囧rz……--Htmlzycq（留言） 2021年2月13日 (六) 00:49 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：[30][31]加进去吧，我认为这反映的是整个维基的制度正在僵化，没想到英文版也有这样的情形。RacCS203病毒的中文条目我有空时写吧，这几天分心跑去写水牛了。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月13日 (六) 07:41 (UTC)[回复]

奇怪，加上的这两个来源也会被戴上：use of deprecated (unreliable) source 标签--Htmlzycq（留言） 2021年2月13日 (六) 08:44 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：希望只是触发标签吧，不要真来个人把那两个来源移除了.....阁下知道英文维基怎么规范在物种条目中使用第一手来源吗？对于大量冷门、无人关注的物种，可能除了最初发表的文献就再也无人提及了（相信机器人刷的物种条目有相当多是这样的），这些英文维基都怎么处理，是不是又画蛇添足地加上一些本身也是取自原始论文的资料库作为来源--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月13日 (六) 09:40 (UTC)[回复]

不知道，英文维基给在下的感觉是不欢迎这一类冷门物种条目。--Htmlzycq（留言） 2021年2月13日 (六) 09:49 (UTC)[回复]

是每日邮报被列为了不可靠来源，已有用户过来删除了，另外，今天终于把上次说的《病毒星球》里提到的科学家（有英文条目的）给建立了stub，顺带瞎翻译了两个来自西班牙语的胡安·曼努埃尔·加西亚-鲁伊斯和马克·戈特施林和两个研究所古斯塔夫·鲁西研究所 乔治·艾莱瓦研究所。--Htmlzycq（留言） 2021年2月13日 (六) 11:53 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：恭喜阁下又成一大功，刚好我懂点西班牙语，晚点看能不能稍微扩充，当作翻译练习...--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月14日 (日) 03:02 (UTC)[回复]

再论鸟类冠状病毒

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@Htmlzycq：这几天又思考了一下棘手的鸟冠状病毒，其实综述条目鸟类的冠状病毒（Coronavirus in birds）是可以写的，这个与鼠的不同，有许多文章以此为主题探讨，介绍gamma与delta中的鸟病毒，我想这篇可大量介绍所有鸟病毒的研究历史，有写到优良条目的潜力。另外gamma的每个物种都独立条目：Avian Coronavirus、鸟冠状病毒9203、鸭冠状病毒2714、鹅冠状病毒CB17、鲸豚冠状病毒，IBV的病毒学内容在Avian Coronavirus条目中介绍，重定向到Avian Coronavirus；火鸡病毒在鸟冠状病毒9203中介绍，重定向到鸟冠状病毒9203。不过Avian Coronavirus的中文名不知要取什么好，鸟冠状病毒？感觉很容易跟综述条目“鸟类的冠状病毒”混淆。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月15日 (一) 06:58 (UTC)[回复]

在下赞成禽冠状病毒，见上表，另有[32]这样的文献将ICTV的Avian Coronavirus译为“禽冠状病毒”当然，把“禽冠状病毒”当作丙丁中可感染鸟的笼统介绍的文章也有--Htmlzycq（留言） 2021年2月15日 (一) 09:08 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：ok，感谢阁下提供这篇，这样禽冠状病毒（物种）跟鸟类的冠状病毒（综述文章）应该比较不会混淆，也可在条目第一行另用模板注明。英文文章中也有一堆Avian Coronavirus拿来当丙丁鸟病毒笼统介绍的。冠状病毒这主条目写到快吐了....--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月15日 (一) 11:26 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：先写了没有争议的雁冠状病毒CB17。剩下的有两个问题

  1. 可能要麻烦阁下帮我看看ICTV 2019 release中把gamma分为三个亚属五个种，报告中有没有介绍这样区分的依据，还有每个种分别包含哪些病毒株，还是这些资讯皆没有提供？
  2. Avian 9203跟Duck2714都是ICTV在整支中有点随意地选了一个病毒株作为物种名（而且ICTV本身没有给出演化树，使用这套新分类系统的文章我只找到两篇[33][34]，主要资讯都是依赖第一篇，第二篇介绍gamma的文段非常诡异，把火鸡、珠鸡的病毒都给当物种了，9203变成只包含野鸟病毒，这应该不符合ICTV的分类）。这样Avian 9203跟Duck2714的条目中，是否应该介绍这些在其他水鸟中发现，过去地位未定，现在被归入这两种的病毒？（ex，某年中国发现哪些鸭鹅的病毒，欧洲发现哪些燕雀的病毒，美国发现哪些巨嘴鸟的病毒.......2020通通给归入Duck2714），这样的处理有没有原创研究疑虑？
  3. 火鸡冠状病毒本身可能就不是单系群（[35]至少欧洲跟北美的有异，再考虑其他地区，可能差别更大，跟IBV根本是没有明确分别的），但FEMS Microbiology的综述文章只有分析火鸡的一个病毒株NC010800，就把火鸡冠状病毒都归入9203这个物种里（(i) AvCoV that comprises some genotypes of IBV, (ii) AvCoV 9203 that similarly comprises some genotypes of IBV and turkey coronavirus；Fig.2右上也只在9203那画了火鸡，比其他种鸟胖了一倍），真实情况应该是有些病毒株属于Avian，有些病毒株属于9203，但因为没有研究去交叉分析所有火鸡病毒株和IBV的关系，我如果这样写又成原创研究了....好像我自己写一篇review投稿到期刊被刊出后，再来维基百科写，才能避开这种问题
  4. 顺便吐槽个，查goose coronavirus，出来都是加拿大鹅这家服饰品牌因为疫情营收下降的新闻；查turkey coronavirus，出来都是土耳其的新冠疫情。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月17日 (三) 22:25 (UTC)[回复]

在ICTV里暂时没找到分类命名的说明。毕竟2019 release中给出太晚了，参考这里的gamma三亚属五种的只有FEMS Microbiology和JVR的两篇文章也很正常，就以FEMS Microbiology里给出的树为准好了。turkey coronavirus估计和IBV一样都不是单系群，个人感觉如果要写条目，就介绍最早发现的那一株/或者是研究最全的那一株。

顺便吐槽个，六种完全没有亲缘关系的猪冠状病毒，这篇文章也能写这么一大段，占了全文三分之一，可能原因是投的是兽医学杂志Journal of Veterinary Research吧，人家可能更关心畜产的病害情况。在维基里，估计建立一个猪冠状病毒的消歧义页就够了--Htmlzycq（留言） 2021年2月18日 (四) 02:54 (UTC)[回复]

序列分析

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@Htmlzycq：去年便在Nature的评论文章上看到柬埔寨有未发表的SARS-CoV-2相关蝙蝠病毒，现在已经出现在biorxiv了[36]，这个大概93%。目前比较近的几支病毒发现处：云南、泰国、柬埔寨，感觉武汉很可能不是第一现场。
猪冠状病毒我给做了个表格，您看看如何。另外昨天写229E的受体丙氨酸氨肽酶，发现infobox好几个栏位显示错误，刚刚上客栈技术版提问了。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月21日 (日) 01:26 (UTC)[回复]

那个表格挺好的，一目了然。在下不才，这几天才刚学会了用MEGA画系统发育树。不知道RshSTT200和RacCS203都放进进化树会怎么样。--Htmlzycq（留言） 2021年2月21日 (日) 03:37 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：我则更加不才，去年就下载了MEGA，但完全还没开始用......之后开始摸索，如果有问题再向您请教。不知阁下有没有兴趣干脆原创研究一篇“SARS-CoV-2 related coronaviruses”(SC2r-CoVs，RacCS203那篇已使用这个名称)，加入比较所有SARS-CoV-2相关的病毒（目前无人完整比较过），用MEGA画树，再综合比较各株异同，发表成PloS Topic Article。待阁下发表，我就当作可靠来源在中文维基画树，放入每个病毒的条目中--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月21日 (日) 08:28 (UTC)[回复]

阁下谦虚了，应该阁下先把文章发表了，在下再在各个stub里引用阁下的系统树，话说阁下有给PloS Topic那边的编辑邮件吗？--Htmlzycq（留言） 2021年2月21日 (日) 09:10 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：上个月弄了个abstract就给忘了....这两天我赶紧来搞。刚顺手把"SARS-CoV-3"的两株写了。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月21日 (日) 11:55 (UTC)[回复]

RmYN02的29671nt的完整序列阁下可以找到吗？在下发给阁下邮箱里的都是NCBI上找的SARS-CoV的ORF1ab的序列，但NCBI上只找到RmYN02的ORF1ab的部分序列--Htmlzycq（留言） 2021年2月24日 (三) 06:48 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：
  1. 可以，研究了一下发现这个序列应该是作者怕人抢了credit，没放上NCBI，只发表在GISAID（个人实在不认同GISAID这种太过保护作者权利，阻止public access的系统），我上去注册了，等核准后我应该能找到这个完整序列。另外发表在biorxiv上的柬埔寨蝙蝠病毒RshSTT182, RshSTT200应该也能在GISAID上找到。
  2. 阁下能收到我的回信吗？前几天您的email不知为何给系统分到了spam folder，不知是不是网易邮件跟gmail的问题。
  3. 发现这篇[37]，这个Zaria CoV是SARSr-CoV的外群，已经跟浙江2013一起被归入Hibecovirus了[38]，另外还有一些去年在加彭发现的蝙蝠病毒[39]，还有Ghana343那一堆病毒，都是感染蹄蝠属蝙蝠，这一块（SARSr-CoV的相似病毒与基群）感觉是文献中特别缺乏的部分，资料零散，阁下如写这个主题的topic article，这部分应该可写成相当精彩的内容。
  4. 一个与生物无关的，感谢阁下创了彼得·R·L·布朗，大学时我读过他的The World of Late Antiquity，受限于背景知识而不太好读，但挺有收获。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年2月24日 (三) 21:36 (UTC)[回复]

Wikipedia Asian Month 2020 Postcard

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Wikipedia Asian Month 2020
Wikipedia Asian Month 2020

Dear Participants and Organizers,

Kindly remind you that we only collect the information for Wikipedia Asian Month postcard 15/02/2021 UTC 23:59. If you haven't filled the Google form, please fill it asap. If you already completed the form, please stay tun, wait for the postcard and tracking emails.

Cheers!

Thank you and best regards,

Wikipedia Asian Month International Team, 2021.01

能否帮助改善紫绒丝膜菌

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在巡查时看到了这篇条目，感觉问题很多，但因为我对真菌不是很精通，只能做一些格式上的修正，能否请您花些时间再做一些校正，谢谢。--クオン·千の海を越えて·夢か……現なのか？ 2021年1月11日 (一) 10:06 (UTC)[回复]

发现原因了，[40]这是爱丁堡大学的学生作业。--Htmlzycq（留言） 2021年1月16日 (六) 02:53 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：这您都能找到....佩服佩服，没想到现在维基作业都能跨语言了，我原以为作者应该不懂中文，但看页面中的名字似乎是华人（不知为何修课学生几乎全是华人，可能这个翻译学程是专门从事中英文间的翻译？）不过他们的课程已于1/15结束，编者应该也不会再管这些条目了。--Wikimycota~🍄 2021年1月16日 (六) 07:45 (UTC)[回复]

请问阁下“Cystidium”一词如何翻译为好？（“间胞”如何？）以及，在下是一名喜爱真菌的编辑新手，所写内容想必错误不少，还请阁下及时指正--TheWindGrahame（留言） 2021年1月18日 (一) 13:40 (UTC)[回复]

果仁蜜饼送给您！

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感谢拨空提点及建议鄙人关于北美红橡的修改方式。 赤羽苍玄（留言） 2021年1月27日 (三) 07:35 (UTC)[回复]

给您的星章！

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友善星章
感谢 阁下一年来提点我关于植物学条目的编写要点。

祝 阁下牛年快乐、事事顺心！ 赤羽苍玄（留言） 2021年2月11日 (四) 11:38 (UTC)[回复]

给您一一只山羊！

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祝前辈新年快乐！都是科研人咱就不说客套话了，祝前辈今年多发文章吧：）

クオン·千の海を越えて·夢か……現なのか？ 2021年2月11日 (四) 16:10 (UTC)[回复]

新年快乐！

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新年快乐！
祝阁下新年快乐，万事如意！感谢您过去一年来对中文维基百科的贡献！—— Eric Liu 创造は生命（留言．留名．学生会） 2021年2月11日 (四) 19:52 (UTC)[回复]

要发送此消息，请使用{{subst:User:和平奋斗救地球/HNY|选填贺词}}。

一杯咖啡送给您！

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谢谢阁下的祝贺，您也是多年来笔耕不辍、在生物学领域贡献甚大，对我而言这也是专业度更高的学问，我也自认是比不上阁下对维基编写的严肃态度近期还因黑历史的硕论来源问题被抽掉一个GA。

麦克阿瑟是卡了很久的条目，在我深入去了解后才发现其西南太平洋战略复杂的难以描述，也希望尽早将它完成。现在的用户名称则是因为有人向我表示太长才改掉的 囧rz……。

扯太远了，谨祝阁下今年能牛年鸿运，万事如意。 Aizag（留言） 2021年2月12日 (五) 21:09 (UTC)[回复]

牛年快乐！

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牛年快乐！
送您一个云南特产——牛虎铜案！您过赞了，我现在觉得写条目对得起自己就好，云南有太多可以写的内容，也不知何时能沉淀足够的知识编写一省条目，我尽量。祝您来年阖家幸福、研究工作顺利、论文必过。同为异乡游子，您也保重！--河水|滇 2021年2月15日 (一) 21:52 (UTC)[回复]

给您一个星章！

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作家星章
如果中文维基百科都是像阁下这样认真、勤奋、谦逊、有判断力的维基人，那该多好啊。 三猎（留言） 2021年2月16日 (二) 06:33 (UTC)[回复]

又有新的关于Letovirinae的信息

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见[41]，英文维基里有人更新了。

另外，在下邮件里又发了新的subgroupA系统树和fasta文件，这次把那个鼠类大规模调查的也放进去了。--Htmlzycq（留言） 2021年3月1日 (一) 09:19 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：多谢，果然如阁下预测，更多Letovirus陆续发现了，我猜鱼类和两生类的会分别成为一物种。鼠类病毒树看起来很完善了，abstract已寄出，就等PloS Genetics的编辑回复（不知道大概要等多久）。
在写ACE2的过程中，发现一篇相当重要的文章[42]，这篇的结论非常有意思（ACE2为受体的性状在Sarbevirus为多次起源）。最重要的是他们发表了三个新的非洲蝙蝠序列，属于"SARS-CoV-3"这支，过去这支是只有BtKY72跟BM48-31的，加上了这三个后画出来的结果，这一支居然不再是基群，反倒是SARS-CoV-2成了基群，不知阁下怎么看这个结果。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月3日 (三) 01:02 (UTC)[回复]
  1. 记得之前就有一个文章推测过冠状病毒利用ACE2可能是多次起源，属于趋同演化。从各个Simplot-Query图看，S基因也是突变最快的，有选择压力在。
  2. 在画鼠类的Embecovirus冠状病毒演化树过程中，感觉还是用ORF1ab的全序列最牢靠，仅仅用其中的RdRp会导致许多置信度很小的分支出现。
  3. 这篇文章中，"SARS-CoV-3"这支是虚线，估计作者也认为此条分支排序于此置信度不高吧。想来SARS-CoV 1、2、3这三支应该在很短的时间内就逐个分离出来了。

--Htmlzycq（留言） 2021年3月3日 (三) 08:18 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：确实这个clade可信度不高，这个树是nsp12去画的，如果拿整个ORF1ab去画应该能有更稳定的结果。要是SARS-CoV-2真的是基群，那东洋区的地域分布与ORF8的起源都变成多次了。我个人对于为何要以ACE2为受体，而非其他千万种膜蛋白也相当有兴趣。
PloS topic投稿指示提供的email是整个PloS Genetics期刊编者的email，不是专门负责topic article的，等一两周如果还没有回应，感觉可以直接到英文维基联络那位负责topic article的用户。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月3日 (三) 21:18 (UTC)[回复]

在下的wikidata讨论里，有人这样提问

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Are you really sure that this zhwiki article describes the Hedgehog coronavirus 1, instead of the Erinaceus coronavirus? Both English and Persian Wikipedias are describing the first, not the second. --Liuxinyu970226 (留言) 01:06, 5 March 2021 (UTC)


在下是这样认为的，阁下当前的条目应该移动到刺猬冠状病毒1，目前发现的刺猬冠状病毒还只有1和HKU31两种，接下来有可能发现更多，估计可以改成穿山甲冠状病毒一类的条目。

  • @Htmlzycq：确实这里也可以分成具体病毒株的条目，以及关于刺猬病毒的综述条目，研究了一下发现刺猬冠状病毒的多样性很低，只有欧洲一个种，东亚一个种（这两个发表后也只有几个新序列陆续再发出，应该也都不是新种），都属于Marbecovirus，倒是发现个有意思的：EriCoV从宿主那偷了一个基因过去[43]。关于条目命名，不知道Hedgehog coronavirus 1这个名字是怎么来的（好像又是ICTV自己取的）？原始论文是叫EriCoV，HKU31的文章以全名（BetaCoV Erinaceus/VMC/DEU/2012）称之，上面这篇刚发表的文章也是称其为ErCoV。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月5日 (五) 20:03 (UTC)[回复]

原来是ICTV起的名字啊，就好像上次的2JL14一样，那要看接下来别人的论文引用是用EriCoV还是Hedgehog coronavirus 1了，之后再决定中文条目名要不要移动。顺便@Liuxinyu970226： --Htmlzycq（留言） 2021年3月7日 (日) 15:57 (UTC)[回复]

有点理解了，它是以每月提报的格式，把tree of life领域中，所有新条目推荐、优特评选的内容群发给这一领域的维基人。

中文可以这样：1，扩大，把生物化学与分子生物学等等内容都囊括进来，以服务更多维基人；2，改造，从Portal:生物学/新进条目入手，改造为类似这样的模式？--Htmlzycq（留言） 2021年3月8日 (一) 00:35 (UTC)[回复]

关于tree of life的Newsletter报导，中文版应该可以涵盖所有生物学、医学的内容（毕竟本来内容、编者都不多），以Portal:生物学/新进条目为基础，每三个月或半年整理通过评选的生物条目，如果有题材可以写短文介绍维基百科上生物条目的发展（例如上期英文版的报导，介绍一个存在十几年的hoax taxon被删除），另外专访活跃写作生物条目的维基人，做成像英文版一样的Nesletter给有兴趣的人订阅。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月8日 (一) 01:55 (UTC)[回复]

加油！希望阁下与其他维基人能够为本地维基百科新闻又添一生力军。—— Eric Liu 创造は生命（留言．留名．学生会） 2021年3月16日 (二) 16:27 (UTC)[回复]

连Avian Coronavirus 9203都闹双胞

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@Htmlzycq：云南再+1[47]，此外发现了跟广西穿山甲病毒接近的蝙蝠病毒。Fig.3A的演化树应包含目前所有已知病毒株了。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月19日 (五) 07:39 (UTC)[回复]

谢谢，不知道在下从en:RaTG13的系统树一节整理出来的en:Template:SARS-CoV-2 related coronavirus接下来该整改成什么样的格式。--Htmlzycq（留言） 2021年3月19日 (五) 16:23 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：有点棘手，这篇文章画出的树形（全基因组、RdRP与ORF1ab）都与原本的差很多，广东广西的穿山甲冠状病毒（加上新发现3个跟穿山甲接近的蝙蝠病毒）竟然成了单系群，或许得再过一两年待更多病毒株发现才会有一个稳定的树形。
刚才没事找事，创立了Portal:病毒，不知道阁下有没有兴趣参与制作。现在英文版用的系统很方便，各栏位随机轮播，基本上把各栏位的列表项目（比如数篇精选病毒、数篇疫情、数篇传记、数篇疗法）建好后，除新闻外不用太多后续维护，不像之前Portal:真菌那些栏位一挂就挂了快十年...--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月22日 (一) 00:53 (UTC)[回复]

之前几天生活琐事太忙了，个人电脑又送修多次，没有及时在wiki和邮件上回复阁下。看到了阁下似乎有点灰心，不过阁下已经“尽人事”了，冠状病毒也成为，这在各语言wiki都缺少生物学贡献者的情况下已经非常难得。Coronavirus in rodents阁下打算先再投PloS One试试？Wikijournal of Science又是怎么一个模式？在下不熟悉

--Htmlzycq（留言） 2021年3月24日 (三) 06:54 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：没事，大概现实中压力太大，而且连写三条大篇幅的条目太累了，本来是觉得中文维基上对生物条目的关注实在太少，但冠状病毒得以高票通过优良条目也令受到很大的鼓励，或许大家还是喜欢看到我写这类条目。我打算再投PloS One，不过得等我现实中的事物先缓缓。Wikijoural是维基学院自办的一个期刊（但是正经期刊，有impact factor的，当然影响力不能跟PloS等相比），也是同行评审后发布成英文维基的条目。
Portal:病毒已经建立完成，各栏位都有10-25个不同条目可轮播展示，每几个小时（或点击页面中的清除快取）便会更换。建立各栏位的过程中看了中文维基病毒条目的概况，实在是惨不忍睹，除了一些疾病条目的导言因为过去有台湾医学计画的人在写，其他条目不是小作品，就是挂满维护模板的问题条目。其实2005年左右便有一位知名维基人专司病毒条目，当年甚至连生物分类的infobox都不存在，他得自己用html画出表格，写作了大量病毒的条目，如今超过15年大部分条目都没有任何改善，大都只列出过时属名、种名就完事了；content bias也相当严重，人类以外的动物病毒极少，植物病毒、噬菌体跟感染其他生物的病毒基本上完全不存在（真菌病毒除外），连植物病毒都是红连。这里列出优特条目几乎都是几位维基人孤狼硬战的成果，相关条目的质量完全不成比例。比对英文版跟德文版，真不知中文何时才能至少把基础的条目大致都写到丙级。--Labyrinthulomycetes🧬A virus is a piece of bad news wrapped in protein 2021年3月24日 (三) 18:17 (UTC)[回复]

在下感觉，中文维基生物条目除了人少以外，还有中文领域本身资料较少。这几天在家看马克·莱纳斯的《科学之种：我们为什么深深地误会了转基因》，顺便写了约瑟夫·谢尔等几个促进植物转基因技术早期发展的科学人物的STUB，发现被誉为“father of plant virology”的马普植物育种所的首任所长Erwin Baur（德语：Erwin Baur）连中文译名都找不到。

PS: 整合蛋白重定向到整合素的这个黑锅应该在下来背才是 囧rz……，在下13年创建整合素这个条目时，只看到有整联蛋白这个另一译名，整合蛋白通常都是指整合膜蛋白，不过不知道什么缘由，在下15年又建立了重定向到整合素的整合蛋白，在2020年整合膜蛋白建立后没有及时修正重定向。--Htmlzycq（留言） 2021年3月25日 (四) 01:23 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：许多生化分生名词的中文翻译相当混乱，如阁下所说，中文的生物资料太少了，或者说以中文写成、有学术水准的生物（科学）资料太少，当我试著查询一些生物名词、人名却完全找不到中文资料时，便常感叹这某种程度上反映了中文是一种相当“落后”的语言，当然不能够与英文这种国际通用语相比，但跟德文、法文、俄文相比也是相形见绌，我身边的人大多认为生物专有名词、论文翻译成中文便难以看懂，改善这种情况也是我参与维基百科的初衷之一。
昨天写了安尼鲁·康特，病毒本身或是疾病的条目若没有生物、医学背景应该真的难以编写，我认为这真的得去大学、研究机构招募更多人进来才能改善，但此类相关人物、书籍、大众文化条目（也包括马克·莱纳斯等）应该是比较好写的。Erwin Baur这种找不到的话可以名跟姓分开查（欧文·鲍尔），再没有就得找外语译音表了。--Labyrinthulomycetes🧬A virus is a piece of bad news wrapped in protein 2021年3月26日 (五) 01:06 (UTC)[回复]

与维基相关的讨论，应该通通在站内公开

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认同阁下的想法，在这里“从我做起”，把邮件内容复制上来，总不能“作法不自毙”吗？隐去邮箱--Htmlzycq（留言） 2021年4月6日 (二) 08:43 (UTC)[回复]

靖天子:冠状病毒我先提到DYK与GA了，不过尚未写到自己心中完全满意的程度，届时再提至FA。最近在维基与现实上还是比较挫折的，PloS Genetics给拒了，ACE2直接提到FA评选又乏人关注，比较灰心。 时 间： 2021年03月17日 04:10 (星期三)

On Mon, Mar 8, 2021 at 10:49 PM 靖天子 wrote:

上周末我私信了Thomas Shafee，刚刚得到回复，他说正在与其他editors商议，其他editor对主题的审核比较严格，必须非常切合PloS Genetics期刊收录的范围，让我再等等。 期望新冠的热点能增进他们收录的意愿，如果最后他们决定不收，Dr. Shafee建议改写到Wikijournal of Science（他是主编），不过我计画还是先问PloS One（这个没有明确范围总该收了吧）

On Mon, Mar 1, 2021 at 3:59 AM 靖天子 wrote: 感谢，这个成果跟新的Letovirus都太有意思了，于是我一不做二不休，熬夜将abstract写完寄出（已cc阁下）

On Mon, Mar 1, 2021 at 1:16 AM htmlzycq wrote: 这次加入了Comparative analysis of rodent and small mammal viromes to better understand the wildlife origin of emerging infectious diseases那篇文章里有全基因组的


htmlzycq:感觉还是Coronavirus in Rodents要紧一些，SARSr-CoV (or SC2rCoV)感觉近一两年会有很大变化，估计现在有不知道多少个小组在华南以及东南亚寻找它们了。

最近不知道是墙还是什么原因wiki老是断，特别是在点编辑的时候，普通的浏览到还行。

彼得·R·L·布朗是在下最近在看本村陵二的《地中海世界与罗马帝国》（讲谈社世界史系列2），中译本的推荐序里将他和彼得·R·L·布朗以及玛丽·比尔德的作品《SPQR》比较，在下就看看中文维基上对这二位是否已有介绍

发现自己之前看过的纪录片《相约古罗马》就是比尔德的编剧并主持，然后发现相约古罗马、《SPQR》、玛丽·比尔德三个条目是16、18、20年由在下在内的不同维基人建立的，三者之间似没有内部链接，一笑

彼得·R·L·布朗，这个名字某种程度上也算是“原创译名”了，那位维基人移动后就更加“原创译名”了。在下不喜欢用某某某 （历史学家）这样的消歧义方式，觉得这样把人“扁平化”了，而更喜欢用中间名来为英美同名同姓人物消歧义，比如肖恩·M·卡罗尔 和 肖恩·B·卡罗尔，直到连中间名也无法消歧义

在 2021-02-25 16:45:38，靖天子 写道：


跟您确认一下，PloS Topic Article的主题，目前似乎有两个可写，一个是Coronavirus in Rodents, 另一个是evolution of SARSr-CoV (or SC2rCoV)，目前先询问一个？

On Wed, Feb 24, 2021 at 5:18 PM htmlzycq wrote: 收到，谢谢，阁下辛苦了

在 2021-02-24 15:05:44，靖天子 写道：

抱歉抱歉，我看到您刚才留言才知道您有来信（不知为何被系统分到spam folder了.....） 序列我这几天有空时找找，找到的话发给您

这几天实验不太顺利一直耽搁.....这礼拜我便会发abstract给plot topic，届时会cc您

On Mon, Feb 22, 2021 at 8:35 AM htmlzycq wrote: 靖天子，你好！我是HTMLZYCQ。


这边qiang好像又高了一些，维基百科又上不去了，下午上的时候试了把刚学的用MEGA画的穿山甲冠状病毒ORF1ab的树传到了维基上，但放上去之后感觉太难看了，囧


附上了mdsx文件以及做的两个图，阁下看看能不能改好看一点

zxc45那两个的没找到，RmYN02的ORF1ab在NCBI上只有片段？


最后，这是我投稿专用邮箱，给plos tropic 项目的编辑发邮件时能转我一份吗？我想看看具体的思路，找找自己能帮上忙的地方

关于冷门国家的科学家

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最近继续给《科学之种》里提到的科学家消红链，在非洲那一章碰到了坦桑尼亚植物病毒学家约瑟夫·顿谷鲁，Joseph Ndunguru，抱着试试看的心态在Wikidata搜一下有没有条目，居然英文的还真有。

说实话Ndunguru这样的词，真不知道怎么发音，根据类似《病毒星球》这样的科普书写科学家小条目，一个好处是译名有来源，书中至少给出了姓氏的译名。

不用像在下当年给 John canton 编了一个“约翰·坎通”的译名，主要是各种外语译音表中都找不到，只好自己根据发音编一个“雅”一点的了

同时在线也发现其实英文维基里 Kinvidia 等用户创建了许多非洲的学者/科学家，限于译名，没办法跟进，可惜了--Htmlzycq（留言） 2021年4月9日 (五) 04:31 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：迦纳的语言契维语（Twi）简称tw，契维语维基百科网址是"tw.wikipedia.org"[48]，因为很多人以为是台湾版，还特地在首页做了个横幅请台湾用户注意这里不是“台湾的维基百科”，我猜这个版本的很多点阅可能都是来自台湾.....WP:外语译音表中没有Twi，可能可以退而求其次用同语族（大西洋-刚果语族）的Wikipedia:外语译音表/斯瓦希里语，Nd这样的辅音可能是翻成“恩德”，作为语言爱好者我挺想以后学一门非洲语言。
看了下这位用户创的条目，确实都是相当有价值的内容，非洲相关内容多不受英美等主流媒体关注，非洲当地的来源网站又不稳定，实在相当难写。--Labyrinthulomycetes🧬A virus is a piece of bad news wrapped in protein 2021年4月10日 (六) 00:40 (UTC)[回复]
（坦桑尼亚的语言是斯瓦希里语，可以直接用中文维基的外语译音表，提到迦纳是因为那位用户是迦纳人，写的很多是迦纳条目，如果能翻译一些过来对中文维基有很大的帮助）

冠状病毒暂时没有什么建议，另外，类似于en:IL17A#Notes这里的{{Academic-written review}}是什么样一种模式？--Htmlzycq（留言） 2021年4月17日 (六) 08:44 (UTC)[回复]

日语版条目数量已经超越越南语版，即将超越瓦瑞瓦瑞语

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算不算是人类维基人同机器人维基搏斗的一场胜利？开玩笑的--Htmlzycq（留言） 2021年4月23日 (五) 02:07 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：好事，但日文版的质量实在有点.....中文是不是又快被阿拉伯文超了啊，而且后面几种语言似乎都开过机器人，会不会突然就跌出20名外了。
我打算从现在开始，将所有缺乏或仍为小作品的分子生物学的基础条目全部扫完（User:靖天子/Molecular Biology Sweep），仅写首段，但希望能根本地改变分生/遗传学条目严重缺乏的情形。--Labyrinthulomycetes🧬 2021年4月23日 (五) 06:00 (UTC)[回复]
我前天点开了最近更改，发现日文似乎编辑频率和我们差不多，40分钟500笔编辑的样子（英文是6分钟内500笔），所以质量和中文也许半斤八两？阿拉伯语最近没有看到开机器人，倒是埃及阿拉伯语有人（非机器人）靠一己之力刷条目（大多为人物条目）超越中文。--Googol19980904（留言） 2021年4月26日 (一) 15:17 (UTC)[回复]
@Googol19980904：编辑深度大概跟我们差不多，但日文版专业条目的质量不怎么样，且一般缺乏脚注、很多条目以条列式撰写而未组织成文，许多条目有日本中心的问题，当然这只是我偶尔点开几条生物条目来看的印象，除英文版外质量比较好的版本我认为是德文跟俄文，特别是俄文的生物条目做得很好。阁下每天创建许多条目是很大的工作量啊，而且涉及领域很广，我挺好奇您是怎么挑条目来写的，其中有许多是重要度很高的条目，例如植物病毒。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全扫 2021年4月27日 (二) 02:00 (UTC)[回复]
大部分都是几句话，毕竟有些是学术类条目，我也不是那个专业的，不过翻译条目的话看懂英文维基的首段应该没太大问题。有总比没有好，建好条目让有兴趣的人来扩充，毕竟很多人不会或不懂得如何创建条目。至于条目领域，那基本上就是所见即所写。相当多的条目是来自于平时的聊天.....--Googol19980904（留言） 2021年4月27日 (二) 03:11 (UTC)[回复]
@Googol19980904：我把植物病毒给写了，可能是我写过条目中难度数一数二的，英文版的来源都因为过时而几乎不能用。以后如果还有写生物学条目，可以列入Portal:生物学/新进条目中。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全扫 2021年4月27日 (二) 23:36 (UTC)[回复]

惭愧，阁下把在下也列为了“一只手数得过来”的几个人之一。在下当初进入维基的初衷就是觉得中文维基分生条目太缺乏了，不过有Shakiestone建立的一系列EC模板，让在下有了先建立一系列导航模板，再根据模板一个个写条目，哪怕只写首段就好，共勉--Htmlzycq（留言） 2021年4月23日 (五) 09:25 (UTC)[回复]

日语版条目数量已经超越瓦瑞瓦瑞语版，埃及阿拉伯语版已经超越越南语版。之前看了埃及阿拉伯语版和阿拉伯语版新建的一些条目，貌似是各种人名，不知道最近埃及版新建的是什么--Htmlzycq（留言） 2021年4月29日 (四) 12:12 (UTC)[回复]

@Googol19980904：“有总比没有好，建好条目让有兴趣的人来扩充，毕竟很多人不会或不懂得如何创建条目。”在下也是这样想的，共勉。--Htmlzycq（留言） 2021年4月29日 (四) 12:12 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：[51]"For example, Gray and his colleagues recently searched for undiscovered coronaviruses in people sick with pneumonia — and quickly found one. The team screened about 400 samples from pneumonia patients in Sarawak in Malaysia. They found at least four people infected with a new coronavirus that likely came from an animal."东洋区应该经常发生冠状病毒（昨天发现连m6A都没有条目，现在打到一半又发现病毒溢出都没有条目.....我去写好了）--Labyrinthulomycetes🧬-分生全扫 2021年5月3日 (一) 18:44 (UTC)[回复]

重复序列

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  • @Htmlzycq：在下觉得{{重复序列}}这个模板挺怪的，首先模板把“重复序列”跟“转座子”视为平行关系，后者应该属于前者才对，还有把gene conversion放在interspersed repeat的子项目，据我所知interspersed repeats包含的范围应该跟transposon是一样的？某基因重复而发生gene conversion的情况感觉不能算是一种interspersed repeat。另外，retrotransposon跟retroposon需要分两个条目吗？这两个词应该几乎在文献中被当作一样的了，英文en:retroposon提到有人把“没有LTR的retrotransposon”（SINE跟LINE）合称为retroposon，又有人将retroposon定义为不编码RT的retrotransposon，没有明确分界，写成两条目可能使人混淆。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全扫 2021年5月8日 (六) 08:16 (UTC)[回复]

真的不懂 囧rz……，transposon这一块估计是在下当初分子生物学课程上最没理解的一块内容。英文维基里较早的版本把转座子纳入重复序列子项目的子项目。 另外，似乎是Howard Temin在区分retrotransposon跟retroposon？--Htmlzycq（留言） 2021年5月9日 (日) 09:06 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：模板我稍微改动了一下。Retrotransposon跟retroposon的区分应该因人标准不同，retroposon用的情况很少。我也觉得英文早期的版本比较合理。今天写LTR反转录转座子跟内源性反转录病毒让我几乎抓狂，文献中混用两者的状况非常严重（例如人类的LTR-retrotransposon很多都直接被称为retrovirus），很多文章语焉不详（找不到够新又够全面的综述文章），英文版就更是全篇迷迷糊糊，惨啊。好在剩下一条DNA transposon，等我过几天干掉之后这方面的基础条目就算扫完了。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全扫 2021年5月9日 (日) 09:19 (UTC)[回复]

又有报道新SARS-related病毒

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石正丽女士最新的BioRxiv预印本：“Identification of a novel lineage bat SARS-related coronaviruses that use bat ACE2 receptor”

报导了RaTG15等8个病毒株，是sars-1与sars-2之外的SARS-related lineage。但可惜的是，没有把肯尼亚到保加利亚的BM48-31、BtKY72那一批被我们称为“sars-cov-3”也纳入系统树（倒是纳入了ZJ2003等），所以不知道RaTG15是不是和“sars-cov-3”一支。--Htmlzycq（留言） 2021年5月26日 (三) 06:04 (UTC)[回复]

一个令人高兴的事，法语维基百科有A1AA1A等用户改进了SARS-CoV-2模板，并建立了RacCS203等多个条目--Htmlzycq（留言） 2021年5月26日 (三) 14:35 (UTC)[回复]

拿呗，就是快半年了，可能需要更新（就等那几篇BioRxiv预印本publish了）

在下想要不要先在英文里建立SARS-CoV-1 related模板，把WIV1、WIV16、HKU3、SHC014病毒--Htmlzycq（留言） 2021年6月12日 (六) 04:01 (UTC)[回复]

英文版的en:Template:SARS-CoV-1 related coronavirus已经写好了，树形参考[54]这篇文章，顺便都放进去了英文en:Severe acute respiratory syndrome–related coronavirus条目中，还联络了法文维基的A1AA1A用户，他说下周就翻译为法语。--Htmlzycq（留言） 2021年6月13日 (日) 06:23 (UTC)[回复]

另外，还看见了用户夏瑾凉安把阁下主编的果子狸SARS冠状病毒、鼠冠状病毒、凯氏带搬运到了英文--Htmlzycq（留言） 2021年6月13日 (日) 06:28 (UTC)[回复]

前几周有看到这几篇被翻译到英文版，挺好的，逆向输出。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全扫 2021年6月13日 (日) 08:49 (UTC)[回复]

另外， Rm1 · Rf1 · Rs672 这三个病毒应该在 SARS-CoV-1 related 这个系统树的哪里？--Htmlzycq（留言） 2021年6月13日 (日) 14:52 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：抱歉忘了回，看了下SARS-1支系的树有点棘手，每篇文章树形都不同，比较新起且涵盖多数病毒株的是[55]（但160B33并非基群），另外还可参考[56][57]，我感觉综合比较之下，Rm1跟Rf1可以放在同支，Rs672应该当成{SARS, WIV1, SHC014, WIV16}的姐妹群，Rp3就更不清楚了，应该跟YNLF_31C接近，但具体位置不好说。
另外（我猜阁下也已经注意到了）很高兴看到A1AA1A在法文维基也开始写这些SARS1与2变种的条目，以及上周上线的这篇文章[58]，RpYN06相似度仅次于RaTG13，但树形不太稳定啊，不知为何英文版模板决定把它画成{SARS-CoV-2, RaTG13}的外群，感觉只是依照相似度数字高低排列，没什么依据（文章中貌似并没有长这样的树）。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全扫 2021年6月19日 (六) 05:15 (UTC)[回复]

把RpYN06画成{SARS-CoV-2, RaTG13}的外群是在下做的，因为RpYN06这篇文章的全基因组树形和别的文章有些不太一样，所以只能当成是外群，待进一步的文章分析吧

SARS-1支系的树，在下都不知道怎么画了，先把16BO133和JTMC15病毒画在一起？--Htmlzycq（留言） 2021年6月19日 (六) 09:20 (UTC)[回复]

用MEGA自己画了一下SARS-1系统树

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截至2021年1月 (2021-01)，SARS-CoV与相关病毒株的系统发生树：

 
 
 
 

BtCoV HKU3 与SARS-COV相似度87.9 % · 中华菊头蝠 · 香港、中国广东 （2004年采集、2005年发表、2010年又发表若干新病毒株）[1]

 
 

Rm1

 
 
 
 
 

Rf1 87.8 % · 马铁菊头蝠 · 中国湖北宜昌 （2004年采集、2005年发表）[2]

 
 
 

16BO133 85 % · 马铁菊头蝠 · 韩国全罗北道 （2016年采集、2019年发表）[3]

 
 

JTMC15 85 %

 
 

JL2012 85 %

 
 
 
 
 
 
 

LYRa11 90.9 % · 中菊头蝠 · 中国云南保山 （2011年采集、2014年发表）[4]

 
 
 
 

Rp3 92.6 % · 皮氏菊头蝠 · 中国广西南宁 （2004年采集、2005年发表）[2]

 
 

Rs672

 
 
 
 

SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中国云南禄丰 （2013年采集、2015年发表）[5]

 
 

SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中国云南禄丰 （2013年采集、2015年发表）[5]

 
 
 
 
 
 

SHC014 95.4 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明 （2011年采集、2013年发表）[6]

 
 

WIV1 95.6 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明 （2012年采集、2013年发表）[6]

 
 
 

WIV16 96.0 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明 （2013年采集、2016年发表）[7]

 
 
 
 

果子狸SARS冠状病毒 99.8 % · 果子狸 · 中国广东[1]

 
 

SARS-CoV 100 %

 
 
 
 
 
 
 

SARS-CoV-2 79 %

 
  蝙蝠病毒
  果子狸病毒
  人类病毒 
參考文獻
  1. ^ 1.0 1.1 Xing‐Yi Ge, Ben Hu, and Zheng‐Li Shi. BAT CORONAVIRUSES. Lin-Fa Wang and Christopher Cowled (编). Bats and Viruses: A New Frontier of Emerging Infectious Diseases, First Edition.. John Wiley & Sons. 2015. 
  2. ^ 2.0 2.1 Li, W. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005, 310 (5748): 676–679. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391. 
  3. ^ Kim Y, Son K, Kim YS, Lee SY, Jheong W, Oem JK. Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea.. Virus Genes. 2019, 55 (4): 545–549. PMC 7089380 可免费查阅. PMID 31076983. doi:10.1007/s11262-019-01668-w. 
  4. ^ He B, Zhang Y, Xu L, Yang W, Yang F, Feng Y; et al. Identification of diverse alphacoronaviruses and genomic characterization of a novel severe acute respiratory syndrome-like coronavirus from bats in China.. J Virol. 2014, 88 (12): 7070–82. PMC 4054348 可免费查阅. PMID 24719429. doi:10.1128/JVI.00631-14. 
  5. ^ 5.0 5.1 Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015, 89 (20): 10532–10547. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01048-15. 
  6. ^ 6.0 6.1 Xing-Yi Ge; Jia-Lu Li; Xing-Lou Yang; et al. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature. 2013, 503 (7477): 535–8. Bibcode:2013Natur.503..535G. PMC 5389864 可免费查阅. PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711. 
  7. ^ Yang XL, Hu B, Wang B, Wang MN, Zhang Q, Zhang W; et al. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus.. J Virol. 2016, 90 (6): 3253–6. PMC 4810638 可免费查阅. PMID 26719272. doi:10.1128/JVI.02582-15. 
  • @Htmlzycq：Good Job!这是全基因组下去画的吗？结果跟今年初那篇一样16BO133不是基群，反而是HKU3、Rm1、Rf1这些相似度更高的更早分家，这点相当有意思啊，照理说16B0133、JTMC15、JL2012这几株一来与SARS的相似度最低，二来地理上最远（吉林与韩国，都在东洋区之外），真不知生物地理学上是怎么演化的，可能整个东北亚还有很多不为人知的SARSr-CoV，只是过去研究者都未曾涉及，只把注意力放在华南西南一带。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全扫 2021年6月21日 (一) 05:36 (UTC)[回复]


是用全基因组下去画的，和上述还有一点点不一样，SARS-CoV与SHC014更近，WIV1和WIV16为一支，图已经发给阁下的邮箱了

16B0133、JTMC15、JL2012这一支全位于吉林与韩国，而且在下的比较显示其与SARS-CoV的相似度在85%以上，没有之前报道的82%，与之最接近的Rf1也位于“华西南”之外的湖北 --Htmlzycq（留言） 2021年6月21日 (一) 05:56 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：多谢。这个图中的SHC014 (MT308984)是Mutant SARS coronavirus Urbani clone SARS-Urbani-MA_SHC014-spike，好像是Ralph Baric做的SARS-CoV骨架、SHC014刺突融合病毒，也就是除了spike来自SHC014之外，其他序列都是来自SARS-CoV Urbani的，不知道我的理解有没有错误，可能是因此才跟SARS-CoV变成一个clade。SHC014的完整序列应该是这个：[59]
看来SARS1基部的那几株还不是很明朗，不知道是有哪些先分出去，还是像阁下的结果这样整支包括HKU3、160OB33、Rf1、Rm1在内都一起分出去。不知阁下有没有看过关于冠状病毒生物地理学的文章（我并没有找到过），感觉是很有意思的课题。这篇显示除吉林那株外，河北陕西山西还各有一株SARSrCoV，不知道会不会也是这一支的。看这篇文章还有几个有趣的发现：原来台湾也发现过SARSr-CoV（CYCU‐R9/TW/2013），可惜只定了RdRp，挺好奇这一株的位置；图中标出了南海诸岛让我一开始以为南沙上都有SARSr-CoV，仔细看才发现根本没有....；以及陕西跟山西的英文就差多一个a。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全扫 2021年6月21日 (一) 23:22 (UTC)[回复]


前几天找了22个SARS-COV-1、WIV1的近源序列，用MEGA花了二十几个小时跑ALIGN，又花了十几个小时跑PHYLOGENY，结果电脑崩溃了，什么都没保存住 囧rz……

不过根据SARS-COV-1、WIV1、WIV16、SHC014这四五个的complete gemone跑的树，当前的树的这一块是对的--Htmlzycq（留言） 2021年6月25日 (五) 10:40 (UTC)[回复]

冠状病毒国际前沿研究与创新论坛

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会议通知 |冠状病毒国际前沿研究与创新论坛 阁下有没有兴趣投个摘要？--Htmlzycq（留言） 2021年6月28日 (一) 16:49 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：有意思，我思考一下，您投吗？
看了最近的条目数统计趋势，貌似再一个月我们应该能一次超过瓦瑞瓦瑞跟越南语这两个当年用机器人刷的版本？漏看了一个0，还早.....--Labyrinthulomycetes🧬-分生全扫 2021年6月30日 (三) 20:09 (UTC)[回复]

还是您来投吧，在下最近时间不多，不知阁下想要投哪个内容，可以邮箱同时发我。年初估算过中文应该2022年超过机器人--Htmlzycq（留言） 2021年7月1日 (四) 04:01 (UTC)[回复]

会议联系人刘博士刚好是在下硕士期间的同届同学，问他他说这个会相对来说还是比较开放，没那么大的难度--Htmlzycq（留言） 2021年7月1日 (四) 15:14 (UTC)[回复]

有位德语维基人问阁下一些关于Ralph S. Baric来源的问题，见在下英文的讨论页 --Htmlzycq（留言） 2021年7月1日 (四) 15:34 (UTC)[回复]

[60]这个视频的前半段是刘博士介绍自己的研究

另外，法语维基里，系统树改成了以RdRp的--Htmlzycq（留言） 2021年7月5日 (一) 05:11 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：最近也比较忙，而且没想到有关于这个论坛五大主题的摘要，大概先不投了，关于之前被拒的那个“鼠类冠状病毒”，在下还是想等有空时（估计年底）试试看PloS One的Topics Article。这几天有空时我得赶紧去回复那位德语维基人，以及更新Baric的条目。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全扫 2021年7月5日 (一) 09:46 (UTC)[回复]

辛苦！--Htmlzycq（留言） 2021年7月5日 (一) 10:34 (UTC)[回复]

[61] Susan R. Weiss的讲课视频，有中译--Htmlzycq（留言） 2021年7月20日 (二) 07:04 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：多谢分享，以前听他的演讲有提到自己做的领域过去都乏人问津（类似Baric实验室本来都要倒了），他都打算退休，但去年时势造英雄，一夕爆红，发觉大家都开始重视他做的东西 囧rz……。这系列课程是专门开给中国观众的吗？
我挺推荐This Week in Virology，很好的节目，深入浅出，特别有几集讲病毒起源、驳斥实验室泄漏说的。--Labyrinthulomycetes🧬-分生全扫 2021年7月24日 (六) 06:16 (UTC)[回复]

那应该是宾夕法尼亚大学的公开课程，不是专门开给中国观众的，Susan R. Weiss是讲者之一，刚好第六讲第七讲是她，我看着名字这么熟悉，想起阁下写过她的条目，就转过来了，应该还有后续，中文还没译全，说实话，这译者还是比较搞怪的 --Htmlzycq（留言） 2021年7月24日 (六) 09:16 (UTC)[回复]

《维基人》2021年3月 第十四期

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给您的星章！

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作家星章
感谢您接受《维基人》的采访！—— Eric Liu 创造は生命（留言．留名．学生会） 2021年3月2日 (二) 15:24 (UTC)[回复]

Re:ACE2已经写完

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谢谢祝福。

谢谢有关ACE2的编辑, 等我看完后, 可以提供生物非专业人士的意见。--Wolfch (留言) 2021年3月4日 (四) 06:31 (UTC)[回复]

有关首段的“SARS-CoV与SARS-CoV-2和ACE2结合的能力应为多次起源，可能与病毒的重组有关。”,　不太清楚“多次起源”意思，意思是这些病毒在发展过程中, 各因为不同的原因而发展了和ACE2结合的能力吗？--Wolfch (留言) 2021年3月4日 (四) 09:44 (UTC)[回复]
@Wolfch：我做个比喻（实际情况更复杂，我假想一个比较单纯的情况），假设一个家族有10种病毒，都是从同一个祖先所衍生而成，这10种病毒都可以与ACE2结合，那很可能这10种病毒的共同祖先也是能与ACE2结合的（或者这个共同祖先不能与ACE2结合，10种病毒是各自分别获得这样的能力，但这个机率就比前者低许多）；假如有9种病毒可以和ACE2结合，1种不行，那么有两种可能：10种病毒的共祖可以与ACE2结合，但有1种自己丧失了这个能力，或者共祖不能与ACE2结合，有9种病毒分别各自获得这个能力（机率比前著低很多）；假如是只有2种病毒可与ACE2结合，另外8种不行，那就比较可能是共祖不能与ACE2结合，这2种病毒是后来各自获得了结合力（另一种情况是共祖可与ACE2结合，但有8种病毒都丧失了结合力，但机率就低许多）
SARS-CoV和SARS-CoV-2就接近上面的第三种情况，它们与ACE2结合的能力应该是趋同演化的结果，所以说是多次起源的。所以“这些病毒在发展过程中，各发展了和ACE2结合的能力”是对的，但“原因”应该是一样的（为了感染细胞）--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月4日 (四) 10:13 (UTC)[回复]
说明的很清楚，谢谢，我想一下有没有其他的词可以代替“多次起源”。--Wolfch (留言) 2021年3月4日 (四) 10:42 (UTC)[回复]
@Wolfch：我稍微改写了这句话，去掉了“多次起源”。--Labyrinthulomycetes🦠receptor 2021年3月4日 (四) 19:03 (UTC)[回复]

Re:‎Portal:病毒

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谢谢您对医学翻译计划的肯定，我会将讯息转给计划的负责人，谢谢您。--Wolfch (留言) 2021年3月22日 (一) 23:32 (UTC)[回复]

有关医学翻译计划贡献，又有提报过DYK的病毒相闗条目, User:Koala0090提供的资料如下：

  • 医学翻译计划曾在2015年扩充过流行性感冒条目，之后在2017年提报过DYK, 同年也通过优良条目和典范条目评选。
  • 普通感冒条目在2012年曾经DYK通过，医学翻译计划后来也在2018年扩充过普通感冒条目（因此DYK的版本和医学翻译计划没有什么关系）

不过上述条目都是和病毒有关疾病的条目，不是介绍病毒的条目，不知是否符合portal:病毒的需求？谢谢 --Wolfch (留言) 2021年3月23日 (二) 08:54 (UTC)[回复]

Re

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术业有专攻而已。

长期以来研究数理化生医学的文献资料绝大多数是英语文献，甚至日语文献都远远超出汉语数倍。

人的精力有限，钻研这些学科的同时做不到仔细衡量汉语措辞，往往只能按英语用词习惯来写，写出来的姑且算“科学式”汉语吧。然而汉语就是汉语，之所以有科学式汉语，不过是汉语没学到家只用根据英语、口语生造措汇乃至句式。

举个可能很多人会觉得不可思议的例子。查教授的小说我觉得很了不起，这不仅是因为情节、想象，更是文笔。从《越女剑》到《鹿鼎记》，全书没有“进行”，没有“XX性”，没有“在少林寺”这类开头，也没有“最XXX之一”，甚至完全没有“之一”，没有“主义”，没有“作出了很大的贡献”，没有“成功”。很多人会认为这是学科差异，我不觉得，我觉得这是汉语学没学到家的问题。

只举一例，汉语本来连男女都不分，哪来的性。但科学界写文章，世间万物的所有特点就像电脑文件“属性”选项，有数以万计的复选框一个个选就行，似乎汉语原有的形容词不管用，其实都是没学到。“永久居民身份证”，“永久”是形容词，形容后面的居民身份证非常通顺，便要故做姿态写成“永久性居民身份证”；某种疾病会传染，非要说某种疾病“有传染性”，传染病要叫“传染性疾病”，极易传染、容易传染、不易传染、不传染，偏要写成“传染性极强、传染性很强、传染性不强、传染性为零”，似乎这样就更有“科学性”般。流行感冒要叫“流行性感冒”，很专业要说很有专业性；他的看法、建议言之有物、脚踏实地、一针见血、说到点子上……非要说“很有建设性”；不可能、可能、有可能、很可能就显得“不科学”，要改成“可能性为零（没有这个可能性）、有这个可能性、可能性很大”，“纪念建筑”非要写“纪念性建筑物”。总而言之，除“性别”、“个性”这类辞汇，汉语稍算入门的都不会写出XX性这种词。

极力建议参考余光中的《中文的常态与变态》，我的总结还远不如他全面。

当然，我上述的看法估计只对大陆人有意义，因为就我的观察不管香港还是台湾，在这方面做法相反。

最后重申，这只是术业有专攻，能在数理化生医领域贡献，汉语学不到家又有什么要紧，再说我也没见过这些领域年轻一代的专业人士有谁在乎。--7（留言） 2021年3月28日 (日) 03:01 (UTC)[回复]

评论得好！身为台湾人，常觉得对汉语的无力！但，先不论政策面，光就自小学习开始，就肩负学汉英两种语言的负担，更何况汉语的语法，个人觉得大家并不重视，实在难以回天！再者，汉语也是有其缺陷的，只能靠政策逆转其弱点，就如1920年发布的《通令采用新式标点符号文》。 --yyfroy 2021年4月17日 (六) 05:30 (UTC)

给您的星章！

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作家星章
了不起的创作！ yyfroy 2021年4月17日 (六) 04:57 (UTC)

卡氏带

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靖天子您好，许久不见，感谢您一直以来对生物条目的无私贡献。想请问，您最新提报DYK的卡氏带发育段落的第二段第一句写到“卡氏带蛋白蛋白为膜蛋白”，请问这是单纯的冗字吗？因为不知道原本想表达什么所以我没有动他。--Yrr933!(留言) 2021年4月17日 (六) 14:20 (UTC)[回复]

@yrr933!：好久不见！是的，多了蛋白二字，感谢您指出。很高兴看到您又开始编辑，且正就读微免生药相关的科系，都十年了.....最近有打算写作哪些条目吗？--Labyrinthulomycetes🧬A virus is a piece of bad news wrapped in protein 2021年4月17日 (六) 18:12 (UTC)[回复]

送您的腺嘌呤核苷三磷酸

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送您的腺嘌呤核苷三磷酸
为您对科学条目的热忱和毅力。 安忆Talk 2021年6月11日 (五) 04:42 (UTC)[回复]

能否帮助改善条目吐鲁番花条蛇

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您好呀，我在试着写新发现的物种吐鲁番花条蛇（User:HaziiDozen/沙盒/4），但不确定二名法定名人的部分是不是这么写。对条目内容我也不是很自信是否概括全面了。希望能得到帮助，如果有错误或者遗漏请告诉我或者直接修改都可以。谢谢～～～🙏🙏--认为久坐对腰不好并强烈建议大家躺着编辑维基百科的HaziiDozen（留言） 2021年6月16日 (三) 08:33 (UTC)[回复]

同行评议邀请（？） 腺相关病毒

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您好，我最近尝试写了一下腺相关病毒，但毕竟隔行如隔山，我现在（包括过去）研究的方向和病毒学相去甚远，因此觉得条目质量很一般。如果您有兴趣，是否愿意提一些建议，做一些改善呢？--クオン·千の海を越えて·残夢 2021年7月9日 (五) 12:40 (UTC)[回复]

给您的星章！

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不倦星章
编辑维基百科条目的过程往往既孤独又繁琐，许多人有知识、能力却未必有心力持续奉献，而您却长期持续为生物学领域条目做出贡献。谨此表达钦佩之意。 灯火阑珊处（留言） 2021年7月13日 (二) 08:51 (UTC)[回复]

请问如何分辨Ganoderma lucidum与Ganoderma lingzhi的幼小子实体？

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靖天子您好！2012年的一篇文献(Cao, Y., Wu, S. H., & Dai, Y. C. (2012). Species clarification of the prize medicinal Ganoderma mushroom “Lingzhi”. Fungal Diversity, 56(1), 49-62.)认为，原产于中国的灵芝与作为灵芝属模式种的亮盖灵芝（ Ganoderma lucidum ）并非同一物种，应当单独定种为Ganoderma lingzhi 。文章还提到Ganoderma lingzhi 成熟子实体的菌管口显黄色，而产自欧洲的Ganoderma lucidum 菌管口为白色；但是否有通过观察区分两者的幼小子实体的方法？

以及如果可以，请问您可否帮助分辨该幼小灵芝子实体属于何种(2021.6.8摄于北京大学镜春园)？

十分感谢！

--TheWindGrahame（留言） 2021年8月3日 (二) 10:28 (UTC)[回复]

  • @TheWindGrahame：读了这篇文章，另外找到这篇[62]，好像都没有提到区分幼小子实体的方法，两者外形太接近，要成熟后才可勉强区分（菌孔颜色、形状、子实体上有黑色条带与否）。不过既然是在北京大学看到的，我猜是G. lingzhi的机率比较大？G. lingzhi主要分布于亚洲，G. lucidum主要分布于欧洲，但是中国也有G. lucidum（原本被归为G. tsugae，但Cao 2012已将G. tsugae处理成G. lucidum的异名），所以不能完全肯定是G. lingzhi。--Mesomycetozoea🧬 2021年8月4日 (三) 05:48 (UTC)[回复]
  • @靖天子：谢谢！另外还请问五棱散尾鬼笔（Lysurus mokusin）与中华散尾鬼笔（Lysurus mokusin f. sinensis（Lloyd）Kobayasi）的区分？英文Wiki那边给出的是中华散尾鬼笔“ having a head that was more angular and conical at the top”（更棱角分明，顶部显圆锥形）因为没有查到原文献（英文Wiki那边给的 Kobayasi Y. (1938). "Hymenogastrineae et Phallineae". In Nakai T, Honda M (eds.). Nova Flora Japonica. Tokyo, Japan: Sanseido Co. p. 52.）所以不太理解......TheWindGrahame（留言） 2021年8月8日 (日) 16:13 (UTC)[回复]
  • @TheWindGrahame：那份文献是日文的（小林义雄. ヒメノガスター亜目及スツポンタケ亜目. 大日本植物誌. 东京: 三省堂. 1938 （日语）. ）确实网路上找不到。英文版条目中引的另一个文献Seok 2005则说

This taxa is very similar to Lysurus mokusin Fr. f. mokusin, but different from it in having the longitudinal angular-conic top of head."

另外查到另一份中文文献（图力古尔、李玉. 吉林省担子菌补记(四). 吉林农业大学学报. 2003, 25 (1): 41-44. ），其中提到

本种有时作为Lysurus mokusin (Pers.)Fr.的变型, 即Lysurus mokusin (Pers.)Fr.f. sinensis(Lioyd)Kobayasi , 与原变型L.mokusin (Pers.)Fr. f.mokusin 的区别在于后者头部的爪形托臂不结合形成尖细的咀。也有人主张将L.sinensis 合并到L.mokusin 中

这样看来，两者的差别非常微小，仅是鬼笔顶部的形状稍有差异（“嘴”的有无），加上鬼笔分类混乱，异名极多，中华散尾鬼笔是否真为有效分类（单系群）也未可知。
这篇条目的英文版质量不错，篇幅也不长，要不要把它翻译过来？（只有一个小问题，英文版说中国仅福建有分布，实际上中国各地均有分布，例如上述的吉林）--Mesomycetozoea🧬 2021年8月12日 (四) 02:40 (UTC)[回复]
@靖天子 或许我可以尝试一下？最近总算也有些时间--TheWindGrahame（留言） 2021年8月16日 (一) 06:09 (UTC)[回复]

Wikipedia:典范条目评选/提名区#紫式部

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我已经再修改好了，不知道阁下有没有再看一次？我至少想有个回应。SANMOSA Σουέζ 2021年8月4日 (三) 08:31 (UTC)[回复]

中文版离越南语版条目数量差距不到5万了

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这个暑假里，中文版条目数量平均日增300+，另外，瑞典语版条目数量从原300多万下跌到298万了，阁下知道怎么回事吗？ --Htmlzycq（留言） 2021年8月9日 (一) 00:22 (UTC)[回复]

  • @Htmlzycq：瓦瑞是不是也有掉？难不成他们良心发现开始清扫那堆垃圾物种条目了......基金会有没有工具可以看各语言条目数每天的增长情形？
阁下参加几天后举行的线上Wikimania吗--Mesomycetozoea🧬 2021年8月12日 (四) 03:01 (UTC)[回复]

在下找了这个页面的编辑历史，瑞典语版是从去年年中373万开始缓慢下跌的，一年来下跌了75万多，估计是瑞典语维基人在手动提删吧；宿务语还在上升，有可能突破600万；瓦瑞语没有往下掉，不过中文版快超过他了。线上Wikimania估计参加不了，在下这里老是掉线 囧rz……--Htmlzycq（留言） 2021年8月12日 (四) 05:11 (UTC)[回复]

@Htmlzycq：宿务语好像也就一个礼拜多个一两篇条目吧。瑞典语虽然机器刷了不少条目，但有些知识类的条目还是蛮全的。--Googol19980904（留言） 2021年8月13日 (五) 04:11 (UTC)[回复]
@Htmlzycq：摸索了一下线上Wikimania实在很难参加.....不过演讲影片都上传到Youtube了，可以慢慢欣赏（有几个人讲的挺有意思的）--Mesomycetozoea🧬 2021年8月15日 (日) 19:58 (UTC)[回复]

有关于Transposable element的讨论

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见en:User_talk:Evolution_and_evolvability#Transposable_element，另外，7-8月间有英文用户创建了冠状病毒S蛋白在内的多个条目，见en:Template:Coronavirus genomes

@Htmlzycq：厉害，都是同一位维基人写的，而且内容都相当丰富，SMEN这四种蛋白都挺难写的，我仅在主条目冠状病毒中介绍（包括5'与3'UTR），我倒是曾想过写ORF3与ORF8这两种对冠状病毒致病、免疫非常重要的蛋白，这两篇目前英文版没有，估计那位维基人很快也会写到。
但是这个模板有一个问题，nonstructural protein X在这里看起来是指辅助蛋白（ORF1a/b与SMEN以外的其他蛋白），只列到ns8，但容易与ORF1a/b编码的14种蛋白（也称为ns）混淆，改称ORFX比较妥当。可能还有因命名未统一而产生的连结问题，例如ORF3b（英语：ORF3b），英文版已经有条目了，模板中的nonstructural protein 3却仍是红字。另一点是这些辅助蛋白在不同冠状病毒的种类与数目经常不同，不同属冠状病毒中名为ORF3的蛋白可能是完全不同的，可能仅能称为ORF3b in SARS-like coronaviruses，而不能称为Coronavirus ORF3b（但即使是SARS-like coronavirus辅助蛋白也可能有异，例如ORF8可能分成8a与8b两个ORF，或者仅有一个完整的ORF），这里命名不好处理，我猜那位维基人可能是因此而暂时止步于结构蛋白。--Mesomycetozoea🧬 2021年9月3日 (五) 06:36 (UTC)[回复]

96.8%

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是在下根据新闻添加的，，不过似乎学界对全基因组相似度不太关心了，更关心RdRP的相似度，比如法文维基的编者已经把SARS-CoV-2树改成了基于RdRP的树。在下一直有一个想法，就是一模板多用，比如:

{{SARS-CoV-2 related coronavirus|whole}} 用于展示基于全基因组的树

{{SARS-CoV-2 related coronavirus|Orf1ab}} 用于展示基于Orf1ab的树

{{SARS-CoV-2 related coronavirus|RdRP}} 用于展示基于RdRP的树

{{SARS-CoV-2 related coronavirus|Spike}} 用于展示基于S基因的树

不过没时间做。--Htmlzycq（留言） 2021年10月31日 (日) 11:12 (UTC)[回复]

给您一个星章！

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立陶宛星章
感谢阁下对本次“立陶宛感谢祭”线上编辑松的踊跃贡献！希望未来阁下能秉持此般热忱，持续贡献维基百科。祝　编安！-Peacearth（留言） 2021年8月25日 (三) 01:25 (UTC)[回复]

给您一个星章！

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编辑星章
感谢靖天子的勉励和提醒，使条目“红枪会”有所改善。先生的认真精神值得所有维基人效法。 Banyangarden（留言） 2021年9月18日 (六) 06:38 (UTC)[回复]

能扩充艾恩宏吗?

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[63]，因也与立陶宛与台湾关系有关。--Outlookxp（留言）

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