嗜壓科維爾氏菌
嗜壓科維爾氏菌 | |
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科學分類 | |
域: | 細菌域 Bacteria |
門: | 假單胞菌門 Pseudomonadota |
綱: | γ-變形菌綱 Gammaproteobacteria |
目: | 交替單胞菌目 Alteromonadales |
科: | 科爾韋氏菌科 Colwelliaceae |
屬: | 科爾韋氏菌屬 Colwellia |
種: | 嗜壓科維爾氏菌 C. piezophila
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二名法 | |
Colwellia piezophila Nogi et al. 2004[1]
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模式菌株 | |
ATCC BAA-637[1] JCM 11831 Y223G |
嗜壓科維爾氏菌(學名:Colwellia piezophila)是科爾韋氏菌屬的下屬物種。[1]此物種是一種革蘭氏陰性、過氧化氫酶陽性、細胞色素c氧化酶、嗜鹽、嗜壓且專性嗜冷的杆狀細菌。[2]此物種最早從日本海溝臨海斜坡上的一個小峽谷底部表面收集的沉積物中分離出來。[3]
歷史
[編輯]嗜壓科維爾氏菌的模式菌株Y223GT和菌株Y251E是在YK 01-06巡航期間,通過Shinkai 6500潛水器上的消毒泥漿採樣器(Ikemoto和Kyo,1993)從日本海溝的一個小深海峽谷底部6278米的深度採集的。泥漿樣品由潛水器的機械手採集並放入滅菌採樣器的樣品架中。然後將樣品帶到海面,溫度不變,但壓力發生了變化。將每個樣品的一部分放入壓力容器中的海洋肉湯並在4°C和60MPa下培養約2周。之後使用低熔點瓊脂方法分離菌株Y223GT和Y251E(Kato等人,1995)。最終嗜壓科維爾氏菌於2004年,被Nogi等人描述。[3]
詞源
[編輯]「piezophila」是一個新拉丁陰性形容詞,由以下組成:[1]
因此,「piezophila」的意思是喜歡壓力或對壓力有親和力。
系統發育學分類
[編輯]基於16S rRNA基因序列的系統發育分析表明菌株Y223GT和菌株Y251E屬於科爾韋氏菌屬。為了分析相關性,在40°C下進行4小時的DNA-DNA雜交,並使用Ezaki等人的方法進行熒光測定。在菌株Y223GT和Y251E之間發現了高水平的DNA-DNA相似性高達98%至100 %。從獲得的雜交值可以看出,Y223GT或Y251E與海水科維爾氏菌參考菌株之間的相似性小於49 %。這明顯低於公認的物種系統發育定義(Wayne等人,1987),這表示菌株Y223GT和Y251E是一種新的科爾韋氏菌物種。[3]
描述
[編輯]嗜壓科維爾氏菌是一種兼性厭氧的革蘭氏陰性菌。它能夠在最佳10°C(不會再2°C以下、15 °C以上或在任何壓力下15℃的環境下生長),最佳60MPa(不會在大氣壓力下生長),最佳3 %NaCl濃度(不會在沒有NaCl的環境下生長)下生長,因此它是一種嗜鹽、嗜壓且專性嗜冷的生物 。它的細胞是杆狀的,長2µm至4µm,寬0.8µm至1µm,靠單極鞭毛運動。它的過氧化氫酶和細胞色素c氧化酶測試呈陽性。[2][3]
參考文獻
[編輯]- ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 Species:Colwellia piezophila. lpsn.dsmz.de. [2023-06-29]. (原始內容存檔於2023-06-29) (英語).
- ^ 2.0 2.1 Podstawka, Adam. Colwellia piezophila Y223G | Type strain | JCM 11831, ATCC BAA 637 | BacDiveID:133697. bacdive.dsmz.de. [2023-06-29]. (原始內容存檔於2023-06-29) (英語).
- ^ 3.0 3.1 3.2 3.3 Nogi, Yuichi; Hosoya, Shoichi; Kato, Chiaki; Horikoshi, Koki. Colwellia piezophila sp. nov., a novel piezophilic species from deep-sea sediments of the Japan Trench. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2004, 54 (5) [2023-06-29]. ISSN 1466-5034. doi:10.1099/ijs.0.03049-0. (原始內容存檔於2023-06-29).