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保守性替換

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ClustalO英語ClustalO生成的五種哺乳動物組蛋白H1序列比對(120-180位點),標記出不保守位點的突變類型。[1]

保守性替換(英語:Conservative ReplacementConservative Substitution),或稱保守性突變(英語:conservative mutation、保留性突變、保存性突變、保守突變、保守替換等,是指性狀相近的氨基酸分子之間的替換英語amino acid replacement,其中的性狀包含分子的離子性疏水性分子量等。[2][3]與之相對的,激進替換(英語:Radical ReplacementRadical Substitution)則是指物理化學性質非常不同的氨基酸所產生的相互替換。[2]

天然編組基因的氨基酸僅有20種,其中部分氨基酸彼此性狀相似。例如,亮氨酸異亮氨酸均為脂肪族化合物,極具疏水性天冬氨酸穀氨酸均小而帶負電等。氨基酸的保守性替換比起非保守性替換影響一般較小,這一點在自然界中可以觀測到:非保守性替換往往造成各種異常,更容易被自然選擇淘汰,故而在自然界中保守性突變更為常見。根據R基團的性質,氨基酸往往依照下表方式分類:

類型 氨基酸
脂肪族 甘氨酸, 丙氨酸, 纈氨酸, 亮氨酸, 異亮氨酸
水合或含/ 絲氨酸, 半胱氨酸, 硒半胱氨酸, 蘇氨酸, 甲硫氨酸
環狀 脯氨酸
芳香族 苯丙氨酸, 酪氨酸, 色氨酸
鹼性 組氨酸, 離胺酸, 精氨酸
酸性及酰胺類 天冬氨酸, 穀氨酸, 天冬酰胺, 穀氨酰胺

參見

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參考資料

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  1. ^ Clustal FAQ #Symbols. Clustal. [8 December 2014]. (原始內容存檔於2016-10-24). 
  2. ^ 2.0 2.1 Zhang, Jianzhi. Rates of Conservative and Radical Nonsynonymous Nucleotide Substitutions in Mammalian Nuclear Genes. Journal of Molecular Evolution. 2000-01-01, 50 (1): 56–68 [2019-01-06]. ISSN 0022-2844. doi:10.1007/s002399910007. (原始內容存檔於2018-09-06) (英語). 
  3. ^ Dagan, Tal; Talmor, Yael; Graur, Dan. Ratios of Radical to Conservative Amino Acid Replacement are Affected by Mutational and Compositional Factors and May Not Be Indicative of Positive Darwinian Selection. Molecular Biology and Evolution. 2002-07-01, 19 (7): 1022–1025 [2019-01-06]. ISSN 0737-4038. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a004161. (原始內容存檔於2018-09-06) (英語). 

外部連結

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